江苏农业学报
江囌農業學報
강소농업학보
JIANGSU JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2015年
1期
45-54
,共10页
钱瑜%察倩倩%孔敏%刘照坤%李英%侯喜林%刘同坤
錢瑜%察倩倩%孔敏%劉照坤%李英%侯喜林%劉同坤
전유%찰천천%공민%류조곤%리영%후희림%류동곤
NRT2%共线性%序列分析%进化
NRT2%共線性%序列分析%進化
NRT2%공선성%서렬분석%진화
NRT2%synteny%sequence analysis%evolution
为了研究硝酸盐转运子NRT2家族在植物中的进化关系,综合利用共线性信息和序列相似性信息,从8种已经进行过全基因组测序的物种(大白菜、大豆、杨树、葡萄、玉米、水稻、高粱、二穗短柄草)中,搜索拟南芥NRT2的同源基因.通过分析发现,这些基因序列基本都具有MFS超家族的NNP家族基因的典型特征.但单、双子叶植物之间,NRT2的基因结构存在着较大的差异.系统发育重建结果表明,NRT2基因家族的成员主要是在单、双子叶植物分歧后进化产生的;同时,不同植物的NRT2基因又具有不同的进化模式.大白菜NRT2家族经历了基因组三倍化事件及基因片段丢失.因此,拟南芥和大白菜的NRT2家族有较为密切的进化关系,进化分析为利用已有的拟南芥NRT2研究结果进一步在大白菜中开展NRT2的功能研究提供了参考线索.
為瞭研究硝痠鹽轉運子NRT2傢族在植物中的進化關繫,綜閤利用共線性信息和序列相似性信息,從8種已經進行過全基因組測序的物種(大白菜、大豆、楊樹、葡萄、玉米、水稻、高粱、二穗短柄草)中,搜索擬南芥NRT2的同源基因.通過分析髮現,這些基因序列基本都具有MFS超傢族的NNP傢族基因的典型特徵.但單、雙子葉植物之間,NRT2的基因結構存在著較大的差異.繫統髮育重建結果錶明,NRT2基因傢族的成員主要是在單、雙子葉植物分歧後進化產生的;同時,不同植物的NRT2基因又具有不同的進化模式.大白菜NRT2傢族經歷瞭基因組三倍化事件及基因片段丟失.因此,擬南芥和大白菜的NRT2傢族有較為密切的進化關繫,進化分析為利用已有的擬南芥NRT2研究結果進一步在大白菜中開展NRT2的功能研究提供瞭參攷線索.
위료연구초산염전운자NRT2가족재식물중적진화관계,종합이용공선성신식화서렬상사성신식,종8충이경진행과전기인조측서적물충(대백채、대두、양수、포도、옥미、수도、고량、이수단병초)중,수색의남개NRT2적동원기인.통과분석발현,저사기인서렬기본도구유MFS초가족적NNP가족기인적전형특정.단단、쌍자협식물지간,NRT2적기인결구존재착교대적차이.계통발육중건결과표명,NRT2기인가족적성원주요시재단、쌍자협식물분기후진화산생적;동시,불동식물적NRT2기인우구유불동적진화모식.대백채NRT2가족경력료기인조삼배화사건급기인편단주실.인차,의남개화대백채적NRT2가족유교위밀절적진화관계,진화분석위이용이유적의남개NRT2연구결과진일보재대백채중개전NRT2적공능연구제공료삼고선색.