辣椒杂志
辣椒雜誌
랄초잡지
JOURNAL OF CHINA CAPSICUM
2015年
1期
1-7
,共7页
李涛%徐小万%黎振兴%王恒明%李植良%李颖
李濤%徐小萬%黎振興%王恆明%李植良%李穎
리도%서소만%려진흥%왕항명%리식량%리영
辣椒%组蛋白去乙酰化%生物信息学分析%基因表达
辣椒%組蛋白去乙酰化%生物信息學分析%基因錶達
랄초%조단백거을선화%생물신식학분석%기인표체
组蛋白去乙酰化在基因表达调控方面扮演重要角色,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用.在基因组范围内,利用生物信息学方法对辣椒的组蛋白去乙酰化(HDAC)基因家族的各成员、分布及结构和功能等进行分析.预测结果显示辣椒HDAC家族包含14个蛋白质,分为3个亚族,其中RPD3/HDA1成员最多,为10个;HD2具有3个成员,SRT2仅有1个成员;其主要分布在8个染色体上,且进化分析结果表明辣椒HDAC基因成员与拟南芥家族具有相似分类.在辣椒HDAC结构域中包含18个重要的基序,同组中的HDAC成员蛋白序列的氨基酸保守结构域基本一致,且各亚族成员的氨基酸保守结构域组成特异,表明这些基序的存在对HDAC蛋白功能的执行是必需的.分析辣椒发育过程中HDAC各成员表达谱数据发现,CaHDA1在果皮和胎座成熟过程中表达量逐渐升高,说明该基因可能参与了辣椒后期果实的发育过程.这将为辣椒HDAC家族基因的深入研究和功能解析提供实验参考依据.
組蛋白去乙酰化在基因錶達調控方麵扮縯重要角色,在植物的生長髮育、器官構建及逆境脅迫和激素信號應答中髮揮重要作用.在基因組範圍內,利用生物信息學方法對辣椒的組蛋白去乙酰化(HDAC)基因傢族的各成員、分佈及結構和功能等進行分析.預測結果顯示辣椒HDAC傢族包含14箇蛋白質,分為3箇亞族,其中RPD3/HDA1成員最多,為10箇;HD2具有3箇成員,SRT2僅有1箇成員;其主要分佈在8箇染色體上,且進化分析結果錶明辣椒HDAC基因成員與擬南芥傢族具有相似分類.在辣椒HDAC結構域中包含18箇重要的基序,同組中的HDAC成員蛋白序列的氨基痠保守結構域基本一緻,且各亞族成員的氨基痠保守結構域組成特異,錶明這些基序的存在對HDAC蛋白功能的執行是必需的.分析辣椒髮育過程中HDAC各成員錶達譜數據髮現,CaHDA1在果皮和胎座成熟過程中錶達量逐漸升高,說明該基因可能參與瞭辣椒後期果實的髮育過程.這將為辣椒HDAC傢族基因的深入研究和功能解析提供實驗參攷依據.
조단백거을선화재기인표체조공방면분연중요각색,재식물적생장발육、기관구건급역경협박화격소신호응답중발휘중요작용.재기인조범위내,이용생물신식학방법대랄초적조단백거을선화(HDAC)기인가족적각성원、분포급결구화공능등진행분석.예측결과현시랄초HDAC가족포함14개단백질,분위3개아족,기중RPD3/HDA1성원최다,위10개;HD2구유3개성원,SRT2부유1개성원;기주요분포재8개염색체상,차진화분석결과표명랄초HDAC기인성원여의남개가족구유상사분류.재랄초HDAC결구역중포함18개중요적기서,동조중적HDAC성원단백서렬적안기산보수결구역기본일치,차각아족성원적안기산보수결구역조성특이,표명저사기서적존재대HDAC단백공능적집행시필수적.분석랄초발육과정중HDAC각성원표체보수거발현,CaHDA1재과피화태좌성숙과정중표체량축점승고,설명해기인가능삼여료랄초후기과실적발육과정.저장위랄초HDAC가족기인적심입연구화공능해석제공실험삼고의거.
