江西农业大学学报
江西農業大學學報
강서농업대학학보
ACTA AGRICULTURAE UNIVERSITATIS JIANGXIENSIS
2015年
2期
205-211
,共7页
雷蕾%潘显强%张露%黄少伟%赵衡%易敏%赖猛
雷蕾%潘顯彊%張露%黃少偉%趙衡%易敏%賴猛
뢰뢰%반현강%장로%황소위%조형%역민%뢰맹
湿地松%萜烯合成酶%同源克隆%β-蒎烯
濕地鬆%萜烯閤成酶%同源剋隆%β-蒎烯
습지송%첩희합성매%동원극륭%β-파희
Pinus elliottii%terpene synthases%homology cloning%β-pinene
通过火炬松等松属树种的cDNA序列同源克隆了湿地松的左旋β-蒎烯合成酶基因( PeTPS-(-) BPin),分析表明该基因与其他松属植物之间的同源性在90%以上,与松科其他属植物之间的同源性在80%以上。裸子植物不同萜烯合成酶基因( TPS)之间的同源性在70%以上。被子植物与裸子植物的TPS基因亲缘关系较远。左旋β-蒎烯合成酶的蛋白质分子式为C3197H4972N862O957S32,分子量为71.74 ku,带弱正电,为不稳定蛋白,易分解,含37个磷酸化位点,定位在叶绿体。蛋白质二级结构含有4个不规则卷曲,24个α-螺旋,三级结构中含有一个cd00684保守域。 ELM中找到7个可能的功能域,包括一个NDR切割位点、两个磷酸肽配体、一个PDZ配体、一个SH2配体、两个磷酸化位点。在68、69位存在一个RR保守结构,猜测能够在第二个R的N末端断裂并与底物结合,从而参与底物异构化。在380~384位出现了DDxxD保守域,但未能在该区搜到可能的功能位点。预测的两个磷酸化位点位于302、623位氨基酸。
通過火炬鬆等鬆屬樹種的cDNA序列同源剋隆瞭濕地鬆的左鏇β-蒎烯閤成酶基因( PeTPS-(-) BPin),分析錶明該基因與其他鬆屬植物之間的同源性在90%以上,與鬆科其他屬植物之間的同源性在80%以上。裸子植物不同萜烯閤成酶基因( TPS)之間的同源性在70%以上。被子植物與裸子植物的TPS基因親緣關繫較遠。左鏇β-蒎烯閤成酶的蛋白質分子式為C3197H4972N862O957S32,分子量為71.74 ku,帶弱正電,為不穩定蛋白,易分解,含37箇燐痠化位點,定位在葉綠體。蛋白質二級結構含有4箇不規則捲麯,24箇α-螺鏇,三級結構中含有一箇cd00684保守域。 ELM中找到7箇可能的功能域,包括一箇NDR切割位點、兩箇燐痠肽配體、一箇PDZ配體、一箇SH2配體、兩箇燐痠化位點。在68、69位存在一箇RR保守結構,猜測能夠在第二箇R的N末耑斷裂併與底物結閤,從而參與底物異構化。在380~384位齣現瞭DDxxD保守域,但未能在該區搜到可能的功能位點。預測的兩箇燐痠化位點位于302、623位氨基痠。
통과화거송등송속수충적cDNA서렬동원극륭료습지송적좌선β-파희합성매기인( PeTPS-(-) BPin),분석표명해기인여기타송속식물지간적동원성재90%이상,여송과기타속식물지간적동원성재80%이상。라자식물불동첩희합성매기인( TPS)지간적동원성재70%이상。피자식물여라자식물적TPS기인친연관계교원。좌선β-파희합성매적단백질분자식위C3197H4972N862O957S32,분자량위71.74 ku,대약정전,위불은정단백,역분해,함37개린산화위점,정위재협록체。단백질이급결구함유4개불규칙권곡,24개α-라선,삼급결구중함유일개cd00684보수역。 ELM중조도7개가능적공능역,포괄일개NDR절할위점、량개린산태배체、일개PDZ배체、일개SH2배체、량개린산화위점。재68、69위존재일개RR보수결구,시측능구재제이개R적N말단단렬병여저물결합,종이삼여저물이구화。재380~384위출현료DDxxD보수역,단미능재해구수도가능적공능위점。예측적량개린산화위점위우302、623위안기산。
The sinistral beta pinene synthetase gene ( PeTPS?(?) BPin) was isolated from Pinus elliottii by the cDNA sequence of pinus such as loblolly pine. Sequence analysis indicated that the deduced protein se?quence of the PeTPS?(?) BPin shared 90% and 80 % of identity with the other Pinus and the other genera of pinaceae,respectively.And the similarities of the sequence with different TPS genes of gymnosperms were 70%,which had distant relationship to angiosperm.The PeTPS?(?)BPin in Pinus elliottii was labile,with a molecular weight of 71.74 ku,phosphorylation site 37,locating in the chloroplasts. There were 4 poikilo?coils and 24 α?helixes on biomolecular structures,and a cd00684 conserved domain on tertiary structure.Seven potential func?tional domains were searched in ELM,including a NDR cleavage site,two phosphopeptide ligands,a PDZ lig?and,a SH2 ligand and two Phosphorylation sites,respectively.ARR conservative domain existed in the 68 and 69 amino acid,it was surmised that the N?terminal on the second R of the RR conservative domain broke,and was combined with the substrates,which participated in the isomerization of the substrates.The DDxxD conser?vative domains appeared but the potential functional site could not be found in the 380~384 amino acid. The two predicted phosphorylation sites located at 302 and 623 amino acid.