CAJ | 학술논문

通过乌拉尔甘草表达序列标签(EST)数据库查找甘草属的SSR位点,并利用Primer 3.0软件在线设计EST SSR引物,对来自甘草属4个种22份材料的EST-SSR指纹图谱特征和聚类结果进行分析,为探讨甘草属种间亲缘关系和疑难种的分类地位提供分子依据.结果显示:(1)去掉冗余序列后共得到441条EST序列,获得504个SSR位点,其中二核苷酸为重复单元的序列最多为350个,占69.44％,重复类型中以TC/AT、TA/AG形式的微卫星最为丰富.(2)设计的40对EST-SSR引物,均能扩增出清晰条带,其中15对引物具有多态性,在22份甘草属植物材料中共获得等位基因59个,平均每对引物检测到3.93个等位基因位点,扩增产物多态性比率为89.44％,能很好地表征甘草属种间的等位基因差异.(3)引物Primer 64对4种甘草属植物均能扩增出特异性条带,黄甘草在180和220 bp 2个位点分别与光果甘草、胀果甘草基因共享,具有杂交种特征.(4)聚类分析表明,当相似性系数为0.82时,22份材料被划分为四组(与经典分类结果一致),第一组为内蒙古杭锦旗分布的乌拉尔甘草;第二组为新疆巴楚分布的光果甘草、黄甘草;第三组为新疆石河子分布的胀果甘草、黄甘草;第四组为新疆石河子分布的乌拉尔甘草;不同居群的黄甘草遗传分化较大,可能与同域分布亲本种的差异及种间的渐渗杂交有关.研究表明,开发的15对EST SSR引物在甘草属内具有很好的适用性,可以为该属的种间亲缘关系和种内遗传分化研究及物种鉴定提供分子依据.
통과오랍이감초표체서렬표첨(EST)수거고사조감초속적SSR위점,병이용Primer 3.0연건재선설계EST SSR인물,대래자감초속4개충22빈재료적EST-SSR지문도보특정화취류결과진행분석,위탐토감초속충간친연관계화의난충적분류지위제공분자의거.결과현시:(1)거도용여서렬후공득도441조EST서렬,획득504개SSR위점,기중이핵감산위중복단원적서렬최다위350개,점69.44％,중복류형중이TC/AT、TA/AG형식적미위성최위봉부.(2)설계적40대EST-SSR인물,균능확증출청석조대,기중15대인물구유다태성,재22빈감초속식물재료중공획득등위기인59개,평균매대인물검측도3.93개등위기인위점,확증산물다태성비솔위89.44％,능흔호지표정감초속충간적등위기인차이.(3)인물Primer 64대4충감초속식물균능확증출특이성조대,황감초재180화220 bp 2개위점분별여광과감초、창과감초기인공향,구유잡교충특정.(4)취류분석표명,당상사성계수위0.82시,22빈재료피화분위사조(여경전분류결과일치),제일조위내몽고항금기분포적오랍이감초;제이조위신강파초분포적광과감초、황감초;제삼조위신강석하자분포적창과감초、황감초;제사조위신강석하자분포적오랍이감초;불동거군적황감초유전분화교대,가능여동역분포친본충적차이급충간적점삼잡교유관.연구표명,개발적15대EST SSR인물재감초속내구유흔호적괄용성,가이위해속적충간친연관계화충내유전분화연구급물충감정제공분자의거.