CAJ | 학술논문

[目的]对两株从轻症病例和重症死亡病例中分离的人H7N9禽流感病毒进行全基因组测序,研究其来源、基因组特征以及相互间的分子差异,旨在了解毒株的遗传进化特征与其致病性及其所致疾病临床类型的关系,为进一步阐明H7N9禽流感病毒的致病机制提供科学依据.[方法]选取两株从轻症病例和重症死亡病例中分离的H7N9禽流感病毒进行全基因组序列测定;运用生物信息学软件比较分析两株病毒的遗传进化关系、基因组特征、受体结合位点、宿主特异性位点及致病相关位点等重要分子特征;从禽流感共享数据(GISAID)下载2013年至2014年10月轻症和重症病例的病毒分离株序列,分析致病相关关键位点差异,并分析这些变异与其致病性及所致疾病临床类型的关系.[结果]这两株H7N9禽流感病毒的HA、NA和M基因来源于2013年华东地区流行的H7N9禽流感病毒,NP、NS、PA、PB1和PB2基因来源于2013年在广东地区禽类中流行的H9N2禽流感病毒;H7N9禽流感病毒PA蛋白L336M和PB1蛋白I368V的突变率随流行时间的延长而逐渐上升,并存在地区差异;两株病毒各基因核苷酸同源性达到99.2％以上,氨基酸同源性在99.5％以上,但各基因节段存在个别氨基酸的差异,其中HA受体结合位点存在一个关键氨基酸的差异(226L和226 Q),宿主特异性位点存在两个关键氨基酸的差异(PB2-591L和PB2-591Q,PB2-627E和PB2-627K),毒力位点存在两个关键氨基酸差异(PA-353R和PA-353K,PB2-627E和PB2-627K);M2均发生了S31N突变;潜在糖基化位点均相对保守;2013年至2014年10月报道的重症病例病毒分离株PB2蛋白E627K突变率高于轻症病例分离株.[结论]两株来自不同临床类型的H7N9禽流感病毒是一种新的重组病毒,是由华东地区流行的人H7N9禽流感病毒和在广东地区禽类中流行的H9N2禽流感病毒基因重组而来;H7N9禽流感病毒的某些致病相关的关键氨基酸位点在流行的过程中不断发生变异,必须密切监测毒株的变异动向;两株致病力不同的病毒各基因节段虽然同源性较高,但存在关键氨基酸位点的差异,其中PB2蛋白627位氨基酸位点的差异可能对病毒的致病性起重要作用,与所致疾病临床类型相关. [目的]對兩株從輕癥病例和重癥死亡病例中分離的人H7N9禽流感病毒進行全基因組測序,研究其來源、基因組特徵以及相互間的分子差異,旨在瞭解毒株的遺傳進化特徵與其緻病性及其所緻疾病臨床類型的關繫,為進一步闡明H7N9禽流感病毒的緻病機製提供科學依據.[方法]選取兩株從輕癥病例和重癥死亡病例中分離的H7N9禽流感病毒進行全基因組序列測定;運用生物信息學軟件比較分析兩株病毒的遺傳進化關繫、基因組特徵、受體結閤位點、宿主特異性位點及緻病相關位點等重要分子特徵;從禽流感共享數據(GISAID)下載2013年至2014年10月輕癥和重癥病例的病毒分離株序列,分析緻病相關關鍵位點差異,併分析這些變異與其緻病性及所緻疾病臨床類型的關繫.[結果]這兩株H7N9禽流感病毒的HA、NA和M基因來源于2013年華東地區流行的H7N9禽流感病毒,NP、NS、PA、PB1和PB2基因來源于2013年在廣東地區禽類中流行的H9N2禽流感病毒;H7N9禽流感病毒PA蛋白L336M和PB1蛋白I368V的突變率隨流行時間的延長而逐漸上升,併存在地區差異;兩株病毒各基因覈苷痠同源性達到99.2％以上,氨基痠同源性在99.5％以上,但各基因節段存在箇彆氨基痠的差異,其中HA受體結閤位點存在一箇關鍵氨基痠的差異(226L和226 Q),宿主特異性位點存在兩箇關鍵氨基痠的差異(PB2-591L和PB2-591Q,PB2-627E和PB2-627K),毒力位點存在兩箇關鍵氨基痠差異(PA-353R和PA-353K,PB2-627E和PB2-627K);M2均髮生瞭S31N突變;潛在糖基化位點均相對保守;2013年至2014年10月報道的重癥病例病毒分離株PB2蛋白E627K突變率高于輕癥病例分離株.[結論]兩株來自不同臨床類型的H7N9禽流感病毒是一種新的重組病毒,是由華東地區流行的人H7N9禽流感病毒和在廣東地區禽類中流行的H9N2禽流感病毒基因重組而來;H7N9禽流感病毒的某些緻病相關的關鍵氨基痠位點在流行的過程中不斷髮生變異,必鬚密切鑑測毒株的變異動嚮;兩株緻病力不同的病毒各基因節段雖然同源性較高,但存在關鍵氨基痠位點的差異,其中PB2蛋白627位氨基痠位點的差異可能對病毒的緻病性起重要作用,與所緻疾病臨床類型相關.
[목적]대량주종경증병례화중증사망병례중분리적인H7N9금류감병독진행전기인조측서,연구기래원、기인조특정이급상호간적분자차이,지재료해독주적유전진화특정여기치병성급기소치질병림상류형적관계,위진일보천명H7N9금류감병독적치병궤제제공과학의거.[방법]선취량주종경증병례화중증사망병례중분리적H7N9금류감병독진행전기인조서렬측정;운용생물신식학연건비교분석량주병독적유전진화관계、기인조특정、수체결합위점、숙주특이성위점급치병상관위점등중요분자특정;종금류감공향수거(GISAID)하재2013년지2014년10월경증화중증병례적병독분리주서렬,분석치병상관관건위점차이,병분석저사변이여기치병성급소치질병림상류형적관계.[결과]저량주H7N9금류감병독적HA、NA화M기인래원우2013년화동지구류행적H7N9금류감병독,NP、NS、PA、PB1화PB2기인래원우2013년재엄동지구금류중류행적H9N2금류감병독;H7N9금류감병독PA단백L336M화PB1단백I368V적돌변솔수류행시간적연장이축점상승,병존재지구차이;량주병독각기인핵감산동원성체도99.2％이상,안기산동원성재99.5％이상,단각기인절단존재개별안기산적차이,기중HA수체결합위점존재일개관건안기산적차이(226L화226 Q),숙주특이성위점존재량개관건안기산적차이(PB2-591L화PB2-591Q,PB2-627E화PB2-627K),독력위점존재량개관건안기산차이(PA-353R화PA-353K,PB2-627E화PB2-627K);M2균발생료S31N돌변;잠재당기화위점균상대보수;2013년지2014년10월보도적중증병례병독분리주PB2단백E627K돌변솔고우경증병례분리주.[결론]량주래자불동림상류형적H7N9금류감병독시일충신적중조병독,시유화동지구류행적인H7N9금류감병독화재엄동지구금류중류행적H9N2금류감병독기인중조이래;H7N9금류감병독적모사치병상관적관건안기산위점재류행적과정중불단발생변이,필수밀절감측독주적변이동향;량주치병력불동적병독각기인절단수연동원성교고,단존재관건안기산위점적차이,기중PB2단백627위안기산위점적차이가능대병독적치병성기중요작용,여소치질병림상류형상관.