植物病理学报
植物病理學報
식물병이학보
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA
2014年
6期
609-619
,共11页
许美容%郑正%李昕昱%洪虹霞%邓晓玲
許美容%鄭正%李昕昱%洪虹霞%鄧曉玲
허미용%정정%리흔욱%홍홍하%산효령
黄龙病%‘Candidatus Liberibacter asiaticus’%短串联重复%遗传多样性
黃龍病%‘Candidatus Liberibacter asiaticus’%短串聯重複%遺傳多樣性
황룡병%‘Candidatus Liberibacter asiaticus’%단천련중복%유전다양성
Huanglongbing%‘Candidatus Liberibacter asiaticus’%short tandem repeats%genetic diversity
韧皮部杆菌亚洲种(‘Candidatus Libriacter asiaticus’,‘Ca.L.asiaticus’)是目前流行范围最广、危害最严重的柑橘黄龙病致病菌.本研究利用‘Ca.L.asiaticus’基因组中全套串联重复基因(short tandem repeat,STR)开发了一套系统的方法用于‘Ca.L.asiaticus’遗传多样性和黄龙病分子流行学研究.PCR和PAGE分析筛选到的36个STR位点中,有33个获得了有效扩增.其中20对引物对不同来源的32个样品的扩增产物多态性较好,最多的可扩增出9种条带类型.采自我国6省的32个‘Ca.L.asiaticus’阳性样品之间的Shannon's信息指数为0.14～1.90,平均为0.68;Nei's基因多样性指数为0.06～0.81,平均为0.38,各省的菌株表现出较高的遗传多样性,特别是来自福建、广西和云南三省的.聚类分析发现可能为中国黄龙病发源地的广东省的黄龙病菌株具有一定的遗传特异性;其余邻省之间存在由木虱传播引起的菌株交流的可能性可以解释该病害在省际间传播.研究表明,开发的STR标记结合PAGE的方法可作为今后菌株遗传多样性和病害分子流行学分析的高效方法.
韌皮部桿菌亞洲種(‘Candidatus Libriacter asiaticus’,‘Ca.L.asiaticus’)是目前流行範圍最廣、危害最嚴重的柑橘黃龍病緻病菌.本研究利用‘Ca.L.asiaticus’基因組中全套串聯重複基因(short tandem repeat,STR)開髮瞭一套繫統的方法用于‘Ca.L.asiaticus’遺傳多樣性和黃龍病分子流行學研究.PCR和PAGE分析篩選到的36箇STR位點中,有33箇穫得瞭有效擴增.其中20對引物對不同來源的32箇樣品的擴增產物多態性較好,最多的可擴增齣9種條帶類型.採自我國6省的32箇‘Ca.L.asiaticus’暘性樣品之間的Shannon's信息指數為0.14～1.90,平均為0.68;Nei's基因多樣性指數為0.06～0.81,平均為0.38,各省的菌株錶現齣較高的遺傳多樣性,特彆是來自福建、廣西和雲南三省的.聚類分析髮現可能為中國黃龍病髮源地的廣東省的黃龍病菌株具有一定的遺傳特異性;其餘鄰省之間存在由木虱傳播引起的菌株交流的可能性可以解釋該病害在省際間傳播.研究錶明,開髮的STR標記結閤PAGE的方法可作為今後菌株遺傳多樣性和病害分子流行學分析的高效方法.
인피부간균아주충(‘Candidatus Libriacter asiaticus’,‘Ca.L.asiaticus’)시목전류행범위최엄、위해최엄중적감귤황룡병치병균.본연구이용‘Ca.L.asiaticus’기인조중전투천련중복기인(short tandem repeat,STR)개발료일투계통적방법용우‘Ca.L.asiaticus’유전다양성화황룡병분자류행학연구.PCR화PAGE분석사선도적36개STR위점중,유33개획득료유효확증.기중20대인물대불동래원적32개양품적확증산물다태성교호,최다적가확증출9충조대류형.채자아국6성적32개‘Ca.L.asiaticus’양성양품지간적Shannon's신식지수위0.14～1.90,평균위0.68;Nei's기인다양성지수위0.06～0.81,평균위0.38,각성적균주표현출교고적유전다양성,특별시래자복건、엄서화운남삼성적.취류분석발현가능위중국황룡병발원지적광동성적황룡병균주구유일정적유전특이성;기여린성지간존재유목슬전파인기적균주교류적가능성가이해석해병해재성제간전파.연구표명,개발적STR표기결합PAGE적방법가작위금후균주유전다양성화병해분자류행학분석적고효방법.
