植物病理学报
植物病理學報
식물병이학보
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA
2014年
4期
370-378
,共9页
万琼莲%杨子祥%王连春%蔡红%陈海如
萬瓊蓮%楊子祥%王連春%蔡紅%陳海如
만경련%양자상%왕련춘%채홍%진해여
云南元谋花生丛枝%植原体%16S rDNA%核糖体蛋白基因%序列分析
雲南元謀花生叢枝%植原體%16S rDNA%覈糖體蛋白基因%序列分析
운남원모화생총지%식원체%16S rDNA%핵당체단백기인%서렬분석
Peanut witches'-broom disease%phytoplasma%16S rDNA%ribosomal protein%sequencing analysis
利用植原体16S rRNA基因及核糖体蛋白基因(ribosomal protein,rp)通用引物对发生在云南元谋的花生丛枝病病株DNA进行PCR扩增,并对扩增片段进行序列测定.扩增获得的云南元谋花生丛枝植原体(PnWB-YNym) 16S rDNA、16S-23S rDNA和23S DNA片段总长1 806bp,rp基因扩增片段长1 171 bp.云南株系与来源于台湾和海南的花生丛枝植原体均有较高同源性.比较16S rDNA片段,发现云南株系在5个位点上与来自台湾或海南的株系存在碱基差异,其中有1个位点的差异是云南元谋株系特异的;再分别比较核糖体蛋白rplV-rpsC 2个基因所编码的氨基酸序列,发现云南株系rpsC编码的第194位氨基酸与台湾和海南的株系存在差异.经16S rDNA片段系统进化及iPhyClassifier在线分析,表明PnWB-YNym在分类上属于16SrⅡ-A亚组成员,与候选种‘Candidatus Phytoplasma australasiae’相关;基于rp基因构建的系统进化树表明,PnWB-YNym与16SrⅡ-A亚组各成员聚为同一亚进化支(iii).
利用植原體16S rRNA基因及覈糖體蛋白基因(ribosomal protein,rp)通用引物對髮生在雲南元謀的花生叢枝病病株DNA進行PCR擴增,併對擴增片段進行序列測定.擴增穫得的雲南元謀花生叢枝植原體(PnWB-YNym) 16S rDNA、16S-23S rDNA和23S DNA片段總長1 806bp,rp基因擴增片段長1 171 bp.雲南株繫與來源于檯灣和海南的花生叢枝植原體均有較高同源性.比較16S rDNA片段,髮現雲南株繫在5箇位點上與來自檯灣或海南的株繫存在堿基差異,其中有1箇位點的差異是雲南元謀株繫特異的;再分彆比較覈糖體蛋白rplV-rpsC 2箇基因所編碼的氨基痠序列,髮現雲南株繫rpsC編碼的第194位氨基痠與檯灣和海南的株繫存在差異.經16S rDNA片段繫統進化及iPhyClassifier在線分析,錶明PnWB-YNym在分類上屬于16SrⅡ-A亞組成員,與候選種‘Candidatus Phytoplasma australasiae’相關;基于rp基因構建的繫統進化樹錶明,PnWB-YNym與16SrⅡ-A亞組各成員聚為同一亞進化支(iii).
이용식원체16S rRNA기인급핵당체단백기인(ribosomal protein,rp)통용인물대발생재운남원모적화생총지병병주DNA진행PCR확증,병대확증편단진행서렬측정.확증획득적운남원모화생총지식원체(PnWB-YNym) 16S rDNA、16S-23S rDNA화23S DNA편단총장1 806bp,rp기인확증편단장1 171 bp.운남주계여래원우태만화해남적화생총지식원체균유교고동원성.비교16S rDNA편단,발현운남주계재5개위점상여래자태만혹해남적주계존재감기차이,기중유1개위점적차이시운남원모주계특이적;재분별비교핵당체단백rplV-rpsC 2개기인소편마적안기산서렬,발현운남주계rpsC편마적제194위안기산여태만화해남적주계존재차이.경16S rDNA편단계통진화급iPhyClassifier재선분석,표명PnWB-YNym재분류상속우16SrⅡ-A아조성원,여후선충‘Candidatus Phytoplasma australasiae’상관;기우rp기인구건적계통진화수표명,PnWB-YNym여16SrⅡ-A아조각성원취위동일아진화지(iii).
