桉树科技
桉樹科技
안수과기
EUCALYPT SCIENCE & TECHNOLOGY
2015年
1期
1-8
,共8页
陈升侃%项东云%邓紫宇%梁建新%蓝必布%李昌荣%梁机
陳升侃%項東雲%鄧紫宇%樑建新%藍必佈%李昌榮%樑機
진승간%항동운%산자우%량건신%람필포%리창영%량궤
粗皮桉%ISSR-PCR%体系优化%单因素试验%正交试验
粗皮桉%ISSR-PCR%體繫優化%單因素試驗%正交試驗
조피안%ISSR-PCR%체계우화%단인소시험%정교시험
Eucalyptus pellita%ISSR-PCR%single factor test%orthogonal experiment
为建立粗皮桉 ISSR-PCR 优化反应体系,先通过单因素试验确定影响粗皮桉 ISSR-PCR 5个因素(Mg<sup>2</sup><sup>+</sup>、dNTP、Taq DNA 聚合酶、DNA 模板、引物)的较适宜浓度范围,在此基础上进一步通过正交试验对5个因素4个水平进行优化,并用 DPS 软件分析试验结果。结果表明粗皮桉 ISSR-PCR 的优反应体系为:在25μL 反应体系中,10×PCR buffer 2.5μL、MgCl 2.0 mmol·L<sup>-</sup><sup>1</sup>、dNTPs 0.3 mmol·L<sup>-</sup><sup>1</sup>、Taq DNA 聚合酶1.25 U、DNA 模板60 ng、引物0.8μmol·L<sup>-</sup><sup>1</sup>。通过梯度试验确定的扩增程序为:94℃预变性5 min,然后按94℃变性1 min,51℃退火3 min,72℃延伸2 min,进行35个循环,最后72℃延伸5 min,4℃保存。
為建立粗皮桉 ISSR-PCR 優化反應體繫,先通過單因素試驗確定影響粗皮桉 ISSR-PCR 5箇因素(Mg<sup>2</sup><sup>+</sup>、dNTP、Taq DNA 聚閤酶、DNA 模闆、引物)的較適宜濃度範圍,在此基礎上進一步通過正交試驗對5箇因素4箇水平進行優化,併用 DPS 軟件分析試驗結果。結果錶明粗皮桉 ISSR-PCR 的優反應體繫為:在25μL 反應體繫中,10×PCR buffer 2.5μL、MgCl 2.0 mmol·L<sup>-</sup><sup>1</sup>、dNTPs 0.3 mmol·L<sup>-</sup><sup>1</sup>、Taq DNA 聚閤酶1.25 U、DNA 模闆60 ng、引物0.8μmol·L<sup>-</sup><sup>1</sup>。通過梯度試驗確定的擴增程序為:94℃預變性5 min,然後按94℃變性1 min,51℃退火3 min,72℃延伸2 min,進行35箇循環,最後72℃延伸5 min,4℃保存。
위건립조피안 ISSR-PCR 우화반응체계,선통과단인소시험학정영향조피안 ISSR-PCR 5개인소(Mg<sup>2</sup><sup>+</sup>、dNTP、Taq DNA 취합매、DNA 모판、인물)적교괄의농도범위,재차기출상진일보통과정교시험대5개인소4개수평진행우화,병용 DPS 연건분석시험결과。결과표명조피안 ISSR-PCR 적우반응체계위:재25μL 반응체계중,10×PCR buffer 2.5μL、MgCl 2.0 mmol·L<sup>-</sup><sup>1</sup>、dNTPs 0.3 mmol·L<sup>-</sup><sup>1</sup>、Taq DNA 취합매1.25 U、DNA 모판60 ng、인물0.8μmol·L<sup>-</sup><sup>1</sup>。통과제도시험학정적확증정서위:94℃예변성5 min,연후안94℃변성1 min,51℃퇴화3 min,72℃연신2 min,진행35개순배,최후72℃연신5 min,4℃보존。
In order to develop an optimized ISSR-PCR analytical system for Eucalyptus pellita, single factor experiments were conducted to determine suitable concentrations of different factors (Mg<sup>2</sup><sup>+</sup>, dNTP, Taq DNA polymerase, DNA template, primer) that influence ISSR-PCR analyses. Based on the optimal concentrations identified, an orthogonal designed trial was carried out in order to optimize 5 factors at 4 levels. The results showed that a suitable ISSR-PCR reaction system involved: 25 μL reaction system containing 10×PCR buffer 2.5 μL, MgCl<sub>2</sub> 2.0 mmol·L<sup>-</sup><sup>1</sup>, dNTPs 0.3 mmol·L<sup>-</sup><sup>1</sup>, Taq DNA polymerase 1.25 U, DNA template 60 ng and primer at 0.8 μmol·L<sup>-</sup><sup>1</sup>. Through gradient testing, the optimized PCR amplification program was determined to involve pre-denaturing at 94℃ for 5 min, then denaturing at 94℃ for 1 min, annealing at 51℃ for 3 min, extension at 72℃ for 2 min over 35 cycles, and finally extension at 72℃ for 5 min. The PCR amplification products were stored at 4℃.