农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2015年
5期
690-700
,共11页
朱友银%王月%张弘%邵姁%李永强%郭卫东
硃友銀%王月%張弘%邵姁%李永彊%郭衛東
주우은%왕월%장홍%소후%리영강%곽위동
中国樱桃%转录组%内参基因%实时定量PCR(qRT-PCR)
中國櫻桃%轉錄組%內參基因%實時定量PCR(qRT-PCR)
중국앵도%전록조%내삼기인%실시정량PCR(qRT-PCR)
Chinese cherry%Transcriptome%Reference gene%Quantitative Real-time PCR (qRT-PCR)
中国樱桃(Prunus pseudocerasus)是一种重要的落叶果树,为了丰富稳定可靠的内参基因,提高实时定量PCR(quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)分析中国樱桃基因表达的准确性,本研究在分析中国樱桃花芽转录组数据的基础上,筛选了表达稳定的微管蛋白(tubulin,TUB)、β肌动蛋自(β-actin,ACTB)、甘油醛-3-磷酸-脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、延伸因子1β(elongation factor 1β,EF1B)、泛素接合酶(ubiquitin-conjugating enzyme,UBCE)、18S rRNA和翻译起始因子5A(translation initiation factor 5A,TIF5A)7个看家基因,分别利用Genorm、Bestkeeper、NormFinder和Delta Ct等计算方法分析了上述基因在4℃、NaCl(300 mmol/L)和脱落酸(ABA)(100 mmol/L)处理下以及低温诱导花芽休眠解除过程中的表达稳定性.综合分析结果表明,GAPDH在4℃和NaCl处理下最稳定,而ACTB和UBCE分别在ABA处理和花芽休眠解除过程中最稳定,说明GAPDH可以作为中国樱桃低温响应和盐碱胁迫处理的内参基因,ACTB和UBCE可以作为ABA处理和花芽休眠解除过程中的内参基因.本研究结果为研究中国樱桃不同生理过程中目的基因表达提供了稳定可靠的内参基因,具有重要参考价值.
中國櫻桃(Prunus pseudocerasus)是一種重要的落葉果樹,為瞭豐富穩定可靠的內參基因,提高實時定量PCR(quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)分析中國櫻桃基因錶達的準確性,本研究在分析中國櫻桃花芽轉錄組數據的基礎上,篩選瞭錶達穩定的微管蛋白(tubulin,TUB)、β肌動蛋自(β-actin,ACTB)、甘油醛-3-燐痠-脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、延伸因子1β(elongation factor 1β,EF1B)、汎素接閤酶(ubiquitin-conjugating enzyme,UBCE)、18S rRNA和翻譯起始因子5A(translation initiation factor 5A,TIF5A)7箇看傢基因,分彆利用Genorm、Bestkeeper、NormFinder和Delta Ct等計算方法分析瞭上述基因在4℃、NaCl(300 mmol/L)和脫落痠(ABA)(100 mmol/L)處理下以及低溫誘導花芽休眠解除過程中的錶達穩定性.綜閤分析結果錶明,GAPDH在4℃和NaCl處理下最穩定,而ACTB和UBCE分彆在ABA處理和花芽休眠解除過程中最穩定,說明GAPDH可以作為中國櫻桃低溫響應和鹽堿脅迫處理的內參基因,ACTB和UBCE可以作為ABA處理和花芽休眠解除過程中的內參基因.本研究結果為研究中國櫻桃不同生理過程中目的基因錶達提供瞭穩定可靠的內參基因,具有重要參攷價值.
중국앵도(Prunus pseudocerasus)시일충중요적락협과수,위료봉부은정가고적내삼기인,제고실시정량PCR(quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)분석중국앵도기인표체적준학성,본연구재분석중국앵도화아전록조수거적기출상,사선료표체은정적미관단백(tubulin,TUB)、β기동단자(β-actin,ACTB)、감유철-3-린산-탈경매(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、연신인자1β(elongation factor 1β,EF1B)、범소접합매(ubiquitin-conjugating enzyme,UBCE)、18S rRNA화번역기시인자5A(translation initiation factor 5A,TIF5A)7개간가기인,분별이용Genorm、Bestkeeper、NormFinder화Delta Ct등계산방법분석료상술기인재4℃、NaCl(300 mmol/L)화탈락산(ABA)(100 mmol/L)처리하이급저온유도화아휴면해제과정중적표체은정성.종합분석결과표명,GAPDH재4℃화NaCl처리하최은정,이ACTB화UBCE분별재ABA처리화화아휴면해제과정중최은정,설명GAPDH가이작위중국앵도저온향응화염감협박처리적내삼기인,ACTB화UBCE가이작위ABA처리화화아휴면해제과정중적내삼기인.본연구결과위연구중국앵도불동생리과정중목적기인표체제공료은정가고적내삼기인,구유중요삼고개치.