水产科学
水產科學
수산과학
FISHERIES SCIENCE
2015年
2期
104-112
,共9页
李石磊%张明%王庆志%王笑月%李大成%刘卫东%刘忠颖%陈远
李石磊%張明%王慶誌%王笑月%李大成%劉衛東%劉忠穎%陳遠
리석뢰%장명%왕경지%왕소월%리대성%류위동%류충영%진원
环节动物%多毛纲%线粒体基因组%结构特征%基因排列%系统发生
環節動物%多毛綱%線粒體基因組%結構特徵%基因排列%繫統髮生
배절동물%다모강%선립체기인조%결구특정%기인배렬%계통발생
为深入开展环节动物的分类及遗传进化等研究,比较分析了已登录到GenBank中16种环节动物全基因组的结构特征.结果发现,16种环节动物线粒体全基因组序列中A+T的含量均超54.3％,碱基G存在低含量的偏向,第三位密码子G含量2.6％～12.7％.基因组的基因组成及排列模式具有一定的保守型,存在5个保守基因联块蔟,线粒体基因组排列顺序在研究环节动物系统发育关系方面起着重要的作用.计算13个编码基因和2个rRNA的基因平均遗传距离,cox1(0.34)相对最保守,atp8(0.8)相对最不保守.大多数环节动物线粒体控制区存在茎环结构.基于13个编码基因氨基酸序列通过3种方法可构建稳健的系统发育树,蛭纲和寡毛纲聚为一进化分枝,构成有环类单系群,蜢虫纲、星虫纲和多毛纲聚为一进化分枝,形成单系群.5个纲间的聚类结果与之前的基于线粒体基因和其他分子标记研究研究结果有所不同.多毛纲呈单系发生,被分为两个主要类群,头节动物中的锥头虫科和缩头虫科没有聚为单独的一进化分枝,而是分别聚类到触角动物下面的足刺动物和沟触角动物,多毛纲内部分类不同于现有的形态学分类结果.
為深入開展環節動物的分類及遺傳進化等研究,比較分析瞭已登錄到GenBank中16種環節動物全基因組的結構特徵.結果髮現,16種環節動物線粒體全基因組序列中A+T的含量均超54.3％,堿基G存在低含量的偏嚮,第三位密碼子G含量2.6％～12.7％.基因組的基因組成及排列模式具有一定的保守型,存在5箇保守基因聯塊蔟,線粒體基因組排列順序在研究環節動物繫統髮育關繫方麵起著重要的作用.計算13箇編碼基因和2箇rRNA的基因平均遺傳距離,cox1(0.34)相對最保守,atp8(0.8)相對最不保守.大多數環節動物線粒體控製區存在莖環結構.基于13箇編碼基因氨基痠序列通過3種方法可構建穩健的繫統髮育樹,蛭綱和寡毛綱聚為一進化分枝,構成有環類單繫群,蜢蟲綱、星蟲綱和多毛綱聚為一進化分枝,形成單繫群.5箇綱間的聚類結果與之前的基于線粒體基因和其他分子標記研究研究結果有所不同.多毛綱呈單繫髮生,被分為兩箇主要類群,頭節動物中的錐頭蟲科和縮頭蟲科沒有聚為單獨的一進化分枝,而是分彆聚類到觸角動物下麵的足刺動物和溝觸角動物,多毛綱內部分類不同于現有的形態學分類結果.
위심입개전배절동물적분류급유전진화등연구,비교분석료이등록도GenBank중16충배절동물전기인조적결구특정.결과발현,16충배절동물선립체전기인조서렬중A+T적함량균초54.3％,감기G존재저함량적편향,제삼위밀마자G함량2.6％～12.7％.기인조적기인조성급배렬모식구유일정적보수형,존재5개보수기인련괴족,선립체기인조배렬순서재연구배절동물계통발육관계방면기착중요적작용.계산13개편마기인화2개rRNA적기인평균유전거리,cox1(0.34)상대최보수,atp8(0.8)상대최불보수.대다수배절동물선립체공제구존재경배결구.기우13개편마기인안기산서렬통과3충방법가구건은건적계통발육수,질강화과모강취위일진화분지,구성유배류단계군,맹충강、성충강화다모강취위일진화분지,형성단계군.5개강간적취류결과여지전적기우선립체기인화기타분자표기연구연구결과유소불동.다모강정단계발생,피분위량개주요류군,두절동물중적추두충과화축두충과몰유취위단독적일진화분지,이시분별취류도촉각동물하면적족자동물화구촉각동물,다모강내부분류불동우현유적형태학분류결과.
