中国生物防治学报
中國生物防治學報
중국생물방치학보
CHINESE JOURNAL OF BIOLOGICAL CONTROL
2015年
1期
85-95
,共11页
杨晓燕%李梅%张林%庞莉%孙青%蒋细良
楊曉燕%李梅%張林%龐莉%孫青%蔣細良
양효연%리매%장림%방리%손청%장세량
哈茨木霉%厚垣孢子%转录组测序%差异表达基因
哈茨木黴%厚垣孢子%轉錄組測序%差異錶達基因
합자목매%후원포자%전록조측서%차이표체기인
Trichoderma harzianum%chlamydospores%transcriptome sequencing%differentially expressed genes
应用高通量转录组测序技术对哈茨木霉产厚垣孢子前期和中期两个不同转录本进行测序,获得12186个unigenes,平均长度为1483 bp.被注释到GO(gene ontology)数据库的unigenes有6042个.通过与KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes pathway database)数据库比对,有5151个unigenes被注释到239条KEGG代谢途径中.比较两个样本,共有差异表达基因(DEG) 6329个,包括3602个上调基因,2727个下调基因.其中几丁质酶基因16个,13个上调、3个下调;几丁质合成酶基因4个,均上调;葡聚糖酶基因21个,11个上调、10个下调.KEGG富集分析显示,氨基糖和核苷酸的糖代谢途径涉及的差异表达基因最多,有23个;其次是淀粉和糖代谢途径,有14个差异表达基因参与.推测这两条代谢途径以及相关的差异表达基因可能与厚垣孢子形成有关.本研究为深入研究哈茨木霉Th-33厚垣孢子的形成机制奠定了基础.
應用高通量轉錄組測序技術對哈茨木黴產厚垣孢子前期和中期兩箇不同轉錄本進行測序,穫得12186箇unigenes,平均長度為1483 bp.被註釋到GO(gene ontology)數據庫的unigenes有6042箇.通過與KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes pathway database)數據庫比對,有5151箇unigenes被註釋到239條KEGG代謝途徑中.比較兩箇樣本,共有差異錶達基因(DEG) 6329箇,包括3602箇上調基因,2727箇下調基因.其中幾丁質酶基因16箇,13箇上調、3箇下調;幾丁質閤成酶基因4箇,均上調;葡聚糖酶基因21箇,11箇上調、10箇下調.KEGG富集分析顯示,氨基糖和覈苷痠的糖代謝途徑涉及的差異錶達基因最多,有23箇;其次是澱粉和糖代謝途徑,有14箇差異錶達基因參與.推測這兩條代謝途徑以及相關的差異錶達基因可能與厚垣孢子形成有關.本研究為深入研究哈茨木黴Th-33厚垣孢子的形成機製奠定瞭基礎.
응용고통량전록조측서기술대합자목매산후원포자전기화중기량개불동전록본진행측서,획득12186개unigenes,평균장도위1483 bp.피주석도GO(gene ontology)수거고적unigenes유6042개.통과여KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes pathway database)수거고비대,유5151개unigenes피주석도239조KEGG대사도경중.비교량개양본,공유차이표체기인(DEG) 6329개,포괄3602개상조기인,2727개하조기인.기중궤정질매기인16개,13개상조、3개하조;궤정질합성매기인4개,균상조;포취당매기인21개,11개상조、10개하조.KEGG부집분석현시,안기당화핵감산적당대사도경섭급적차이표체기인최다,유23개;기차시정분화당대사도경,유14개차이표체기인삼여.추측저량조대사도경이급상관적차이표체기인가능여후원포자형성유관.본연구위심입연구합자목매Th-33후원포자적형성궤제전정료기출.
