中国抗生素杂志
中國抗生素雜誌
중국항생소잡지
CHINESE JOURNAL OF ANTIBIOTICS
2015年
4期
245-250,277
,共7页
彭冉%赵立岭%曹赞霞%王吉华
彭冉%趙立嶺%曹讚霞%王吉華
팽염%조립령%조찬하%왕길화
分子动力学模拟%抗菌肽%LL-37%α-螺旋结构
分子動力學模擬%抗菌肽%LL-37%α-螺鏇結構
분자동역학모의%항균태%LL-37%α-라선결구
Molecular dynamics simulation%Antimicrobial peptide%LL-37%α-helix structure
目的 研究溶液pH变化对抗菌肽LL-37结构的影响.方法 利用分子动力学模拟方法,采用GROMACS软件包和OPLS-AA力场,分别在中性和强碱性条件下对LL-37进行模拟,总模拟时间达1微秒,最后对模拟轨迹进行分析处理.结果 LL-37在中性环境下具有部分螺旋结构存在,特别是N端部分残基,结构具有较大柔性;在强碱性环境下,螺旋含量增多,抗菌核心区域残基形成螺旋结构的几率明显增大,结构稳定性增强.结论 pH值的增大会促进LL-37螺旋结构的形成,螺旋结构的形成和与膜结合是协同的.N端残基易形成螺旋,然后是抗菌核心区域.LL-37在中性环境下的结构特征与其行使多功能的角色相一致.该研究首次分析了LL-37在中性环境下的结构特征及pH的影响,有助于认识其抗菌机制及新药设计.
目的 研究溶液pH變化對抗菌肽LL-37結構的影響.方法 利用分子動力學模擬方法,採用GROMACS軟件包和OPLS-AA力場,分彆在中性和彊堿性條件下對LL-37進行模擬,總模擬時間達1微秒,最後對模擬軌跡進行分析處理.結果 LL-37在中性環境下具有部分螺鏇結構存在,特彆是N耑部分殘基,結構具有較大柔性;在彊堿性環境下,螺鏇含量增多,抗菌覈心區域殘基形成螺鏇結構的幾率明顯增大,結構穩定性增彊.結論 pH值的增大會促進LL-37螺鏇結構的形成,螺鏇結構的形成和與膜結閤是協同的.N耑殘基易形成螺鏇,然後是抗菌覈心區域.LL-37在中性環境下的結構特徵與其行使多功能的角色相一緻.該研究首次分析瞭LL-37在中性環境下的結構特徵及pH的影響,有助于認識其抗菌機製及新藥設計.
목적 연구용액pH변화대항균태LL-37결구적영향.방법 이용분자동역학모의방법,채용GROMACS연건포화OPLS-AA력장,분별재중성화강감성조건하대LL-37진행모의,총모의시간체1미초,최후대모의궤적진행분석처리.결과 LL-37재중성배경하구유부분라선결구존재,특별시N단부분잔기,결구구유교대유성;재강감성배경하,라선함량증다,항균핵심구역잔기형성라선결구적궤솔명현증대,결구은정성증강.결론 pH치적증대회촉진LL-37라선결구적형성,라선결구적형성화여막결합시협동적.N단잔기역형성라선,연후시항균핵심구역.LL-37재중성배경하적결구특정여기행사다공능적각색상일치.해연구수차분석료LL-37재중성배경하적결구특정급pH적영향,유조우인식기항균궤제급신약설계.
