热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2015年
3期
480-486
,共7页
苦瓜%McRABD2c%McAGD8%序列分析
苦瓜%McRABD2c%McAGD8%序列分析
고과%McRABD2c%McAGD8%서렬분석
Momordica charantia%McRABD2c%McAGD8%Sequence analysis
构建并筛选苦瓜成熟果实cDNA文库,分离获得2个全长cDNA序列(命名为Mc RA BD2c和McA GD8).序列分析结果表明:McA GD8长度为1 695 bp,含有1个1 209 bp开放阅读框,编码403个氨基酸,该蛋白含有1个保守的Arf GAP结构域,与黄瓜CsAGD8-like具有90％的同源性,同甜瓜CmAGD8具有89％的同源性.McRA BD2c长度为1 166 bp,含有1个609 bp开放阅读框,推测编码202个氨基酸,该蛋白含有Rab家族保守的RabSF (RabSF1-RabSF4)模体及特有的RabF模体(RabF1-RabF5);5个G结构域和2个构象变构域(Switch Ⅰ、SwitchⅡ)及C末端的CCX序列,同CsRABD2C-like同源性高达99％.氨基酸同源比对及进化分析结果表明McRABD2属于小G蛋白,而McAGD8属于Arf小G蛋白下游的效应基因.
構建併篩選苦瓜成熟果實cDNA文庫,分離穫得2箇全長cDNA序列(命名為Mc RA BD2c和McA GD8).序列分析結果錶明:McA GD8長度為1 695 bp,含有1箇1 209 bp開放閱讀框,編碼403箇氨基痠,該蛋白含有1箇保守的Arf GAP結構域,與黃瓜CsAGD8-like具有90％的同源性,同甜瓜CmAGD8具有89％的同源性.McRA BD2c長度為1 166 bp,含有1箇609 bp開放閱讀框,推測編碼202箇氨基痠,該蛋白含有Rab傢族保守的RabSF (RabSF1-RabSF4)模體及特有的RabF模體(RabF1-RabF5);5箇G結構域和2箇構象變構域(Switch Ⅰ、SwitchⅡ)及C末耑的CCX序列,同CsRABD2C-like同源性高達99％.氨基痠同源比對及進化分析結果錶明McRABD2屬于小G蛋白,而McAGD8屬于Arf小G蛋白下遊的效應基因.
구건병사선고과성숙과실cDNA문고,분리획득2개전장cDNA서렬(명명위Mc RA BD2c화McA GD8).서렬분석결과표명:McA GD8장도위1 695 bp,함유1개1 209 bp개방열독광,편마403개안기산,해단백함유1개보수적Arf GAP결구역,여황과CsAGD8-like구유90％적동원성,동첨과CmAGD8구유89％적동원성.McRA BD2c장도위1 166 bp,함유1개609 bp개방열독광,추측편마202개안기산,해단백함유Rab가족보수적RabSF (RabSF1-RabSF4)모체급특유적RabF모체(RabF1-RabF5);5개G결구역화2개구상변구역(Switch Ⅰ、SwitchⅡ)급C말단적CCX서렬,동CsRABD2C-like동원성고체99％.안기산동원비대급진화분석결과표명McRABD2속우소G단백,이McAGD8속우Arf소G단백하유적효응기인.
