江汉大学学报(自然科学版)
江漢大學學報(自然科學版)
강한대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF JIANGHAN UNIVERSITY(NATURAL SCIENCES)
2015年
2期
111-115
,共5页
于涛%朱紫洪%郝栋梁%彭黎%张攀%徐号%郭旭
于濤%硃紫洪%郝棟樑%彭黎%張攀%徐號%郭旭
우도%주자홍%학동량%팽려%장반%서호%곽욱
同源建模%氯离子通道蛋白质%SWISS-MODEL
同源建模%氯離子通道蛋白質%SWISS-MODEL
동원건모%록리자통도단백질%SWISS-MODEL
homology modeling%chloride channel protein%SWISS-MODEL
ClC型氯离子通道蛋白质在调节生命体的新陈代谢过程中起着重要作用。在原有蛋白质ClC-ec1晶体结构的基础上,依据同源建模的原理,借助SWISS-MODEL网络服务器构建了一类重要氯离子通道蛋白质ClC-0的空间结构,同时对所得结构的合理性进行了分析。通过衡量结构的Z-score值、分析结构的空间坐标波动性以及利用视图软件VMD将建模的ClC-0结构和模板结构进行比较,发现通过同源建模所得到蛋白质ClC-0的空间结构符合后续研究的要求,这在很大程度上方便了该类蛋白质的后续计算模拟研究。
ClC型氯離子通道蛋白質在調節生命體的新陳代謝過程中起著重要作用。在原有蛋白質ClC-ec1晶體結構的基礎上,依據同源建模的原理,藉助SWISS-MODEL網絡服務器構建瞭一類重要氯離子通道蛋白質ClC-0的空間結構,同時對所得結構的閤理性進行瞭分析。通過衡量結構的Z-score值、分析結構的空間坐標波動性以及利用視圖軟件VMD將建模的ClC-0結構和模闆結構進行比較,髮現通過同源建模所得到蛋白質ClC-0的空間結構符閤後續研究的要求,這在很大程度上方便瞭該類蛋白質的後續計算模擬研究。
ClC형록리자통도단백질재조절생명체적신진대사과정중기착중요작용。재원유단백질ClC-ec1정체결구적기출상,의거동원건모적원리,차조SWISS-MODEL망락복무기구건료일류중요록리자통도단백질ClC-0적공간결구,동시대소득결구적합이성진행료분석。통과형량결구적Z-score치、분석결구적공간좌표파동성이급이용시도연건VMD장건모적ClC-0결구화모판결구진행비교,발현통과동원건모소득도단백질ClC-0적공간결구부합후속연구적요구,저재흔대정도상방편료해류단백질적후속계산모의연구。
CIC-type chloride ion channel proteins play important role in regulating the metabolism process of biological system. On the base of CIC-ec1 crystal structure,in accordance with the principle of homology modeling,using SWISS-MODEL net server,constructed the spatial structure of a kind of CIC-0 chloride ion channel protein , and analyzed the reasonableness of the obtained structure. Through measuring the Z-score of the structure ,analyzing the fluctuation of space coordinates of the structure , and comparing the modeling CIC-0 structure with template structure,discovered that the spatial structure of CIC-0 protein by homology modeling complied with the requirement of further study ,which makes the further simulation and computation be easy.