海洋渔业
海洋漁業
해양어업
MARINE FISHERIES
2015年
2期
122-127
,共6页
李超%侯吉伦%王桂兴%张晓彦%刘永富%童爱萍%刘海金
李超%侯吉倫%王桂興%張曉彥%劉永富%童愛萍%劉海金
리초%후길륜%왕계흥%장효언%류영부%동애평%류해금
牙鲆%转录组测序%SSR标记
牙鲆%轉錄組測序%SSR標記
아평%전록조측서%SSR표기
Paralichthys olivaceus%RNA-seq%SSR marker
通过对牙鲆(Paralichthys olivaceus)进行转录组测序(RNA-seq),利用MicroSAtellite (MISA)软件对1～6个碱基重复、碱基数在10 bp以上的微卫星进行鉴定.结果表明,牙鲆转录组水平上,共发现42 183个SSR位点,分布在26 457条Unigene上,发生频率为27.12％,平均密度为339个/Mbp.获得的SSR一共有216种重复基元,其中二核苷酸重复基元类型数量最多,共有17 570个,占所鉴定SSR总数的41.65％.同时用SPSS statistics 20.0软件对牙鲆转录组SSR的多态性进行了评估.
通過對牙鲆(Paralichthys olivaceus)進行轉錄組測序(RNA-seq),利用MicroSAtellite (MISA)軟件對1～6箇堿基重複、堿基數在10 bp以上的微衛星進行鑒定.結果錶明,牙鲆轉錄組水平上,共髮現42 183箇SSR位點,分佈在26 457條Unigene上,髮生頻率為27.12％,平均密度為339箇/Mbp.穫得的SSR一共有216種重複基元,其中二覈苷痠重複基元類型數量最多,共有17 570箇,佔所鑒定SSR總數的41.65％.同時用SPSS statistics 20.0軟件對牙鲆轉錄組SSR的多態性進行瞭評估.
통과대아평(Paralichthys olivaceus)진행전록조측서(RNA-seq),이용MicroSAtellite (MISA)연건대1～6개감기중복、감기수재10 bp이상적미위성진행감정.결과표명,아평전록조수평상,공발현42 183개SSR위점,분포재26 457조Unigene상,발생빈솔위27.12％,평균밀도위339개/Mbp.획득적SSR일공유216충중복기원,기중이핵감산중복기원류형수량최다,공유17 570개,점소감정SSR총수적41.65％.동시용SPSS statistics 20.0연건대아평전록조SSR적다태성진행료평고.
