医学信息
醫學信息
의학신식
MEDICAL INFORMATION
2015年
18期
10-10
,共1页
李秀宁%高超%刘翰楠%吴健勇%唐勇
李秀寧%高超%劉翰楠%吳健勇%唐勇
리수저%고초%류한남%오건용%당용
膀胱癌转移%分子机制%生物信息学
膀胱癌轉移%分子機製%生物信息學
방광암전이%분자궤제%생물신식학
目的探讨膀胱癌转移的分子机制。方法运用生物信息学的方法,在基因表达综合数据库(Gene Expres ion Omnibus,简称GEO)数据库搜索下载符合纳入标准的芯片系列数据,分转移组和非转移组后用BRB-ar ay-Tools筛选出两组间的差异表达基因,对差异表达基因进行比对,在PATHER在线工具分析一致性高的上调或者下调基因。将差异表达基因在DAVID的KEGG进行富集通路分析。结果得到膀胱癌转移和非转移组差异表达基因中一致性高的基因,ALG13表达上调,CIB2表达下调。通过基因富集分析得到膀胱癌转移的可能通路。结论膀胱癌转移组和非转移组差异表达基因富集的通路主要有:P53信号通路,Wnt信号通路,TGF-β信号通路,P53、VEGF、ErbB等信号通路,磷脂酰肌醇信号通路,mTOR通路,MAPK信号通路。这些通路的主要效应为调节肌丝蛋白和细胞骨架,其次为细胞的增殖、分化、新生血管形成和免疫反应等。
目的探討膀胱癌轉移的分子機製。方法運用生物信息學的方法,在基因錶達綜閤數據庫(Gene Expres ion Omnibus,簡稱GEO)數據庫搜索下載符閤納入標準的芯片繫列數據,分轉移組和非轉移組後用BRB-ar ay-Tools篩選齣兩組間的差異錶達基因,對差異錶達基因進行比對,在PATHER在線工具分析一緻性高的上調或者下調基因。將差異錶達基因在DAVID的KEGG進行富集通路分析。結果得到膀胱癌轉移和非轉移組差異錶達基因中一緻性高的基因,ALG13錶達上調,CIB2錶達下調。通過基因富集分析得到膀胱癌轉移的可能通路。結論膀胱癌轉移組和非轉移組差異錶達基因富集的通路主要有:P53信號通路,Wnt信號通路,TGF-β信號通路,P53、VEGF、ErbB等信號通路,燐脂酰肌醇信號通路,mTOR通路,MAPK信號通路。這些通路的主要效應為調節肌絲蛋白和細胞骨架,其次為細胞的增殖、分化、新生血管形成和免疫反應等。
목적탐토방광암전이적분자궤제。방법운용생물신식학적방법,재기인표체종합수거고(Gene Expres ion Omnibus,간칭GEO)수거고수색하재부합납입표준적심편계렬수거,분전이조화비전이조후용BRB-ar ay-Tools사선출량조간적차이표체기인,대차이표체기인진행비대,재PATHER재선공구분석일치성고적상조혹자하조기인。장차이표체기인재DAVID적KEGG진행부집통로분석。결과득도방광암전이화비전이조차이표체기인중일치성고적기인,ALG13표체상조,CIB2표체하조。통과기인부집분석득도방광암전이적가능통로。결론방광암전이조화비전이조차이표체기인부집적통로주요유:P53신호통로,Wnt신호통로,TGF-β신호통로,P53、VEGF、ErbB등신호통로,린지선기순신호통로,mTOR통로,MAPK신호통로。저사통로적주요효응위조절기사단백화세포골가,기차위세포적증식、분화、신생혈관형성화면역반응등。