质谱学报
質譜學報
질보학보
2015年
3期
193-198
,共6页
铜绿假单胞菌%蛋白质组学%SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳%离线二维色谱
銅綠假單胞菌%蛋白質組學%SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳%離線二維色譜
동록가단포균%단백질조학%SDS-취병희선알응효전영%리선이유색보
pseudomonas aeruginosa%proteome%SDS-PAGE%offline-2DLC
近年来,石油泄漏对海洋和土壤的污染事件频发,解决这一污染问题非常重要.本实验从原油污染的土壤中分离得到一株新的铜绿假单胞菌株SJTD-1,使用SDS-PAGE-1 DLC-MS和offline-2DLC-MS两种方法研究其全蛋白质组.利用这两种技术平台分别鉴定获得1 453个和1 623个可信蛋白,共鉴定到1 912个可信蛋白.通过比较两种技术路线所鉴定到蛋白种类的差异,发现offline-2DLC-MS有利于SJTD-1菌株的膜蛋白、相对分子质量较大的蛋白和pI值不大于8的蛋白的鉴定.另外,对所有鉴定到的可信蛋白进行GO功能注释,亚细胞定位分析和代谢通路富集分析.通过对分离获得的SJTD-1菌株进行蛋白质组学分析,可为铜绿假单胞菌SJTD-1分解环烷烃以及SJTD-1在生物修复应用中的研究奠定基础.
近年來,石油洩漏對海洋和土壤的汙染事件頻髮,解決這一汙染問題非常重要.本實驗從原油汙染的土壤中分離得到一株新的銅綠假單胞菌株SJTD-1,使用SDS-PAGE-1 DLC-MS和offline-2DLC-MS兩種方法研究其全蛋白質組.利用這兩種技術平檯分彆鑒定穫得1 453箇和1 623箇可信蛋白,共鑒定到1 912箇可信蛋白.通過比較兩種技術路線所鑒定到蛋白種類的差異,髮現offline-2DLC-MS有利于SJTD-1菌株的膜蛋白、相對分子質量較大的蛋白和pI值不大于8的蛋白的鑒定.另外,對所有鑒定到的可信蛋白進行GO功能註釋,亞細胞定位分析和代謝通路富集分析.通過對分離穫得的SJTD-1菌株進行蛋白質組學分析,可為銅綠假單胞菌SJTD-1分解環烷烴以及SJTD-1在生物脩複應用中的研究奠定基礎.
근년래,석유설루대해양화토양적오염사건빈발,해결저일오염문제비상중요.본실험종원유오염적토양중분리득도일주신적동록가단포균주SJTD-1,사용SDS-PAGE-1 DLC-MS화offline-2DLC-MS량충방법연구기전단백질조.이용저량충기술평태분별감정획득1 453개화1 623개가신단백,공감정도1 912개가신단백.통과비교량충기술로선소감정도단백충류적차이,발현offline-2DLC-MS유리우SJTD-1균주적막단백、상대분자질량교대적단백화pI치불대우8적단백적감정.령외,대소유감정도적가신단백진행GO공능주석,아세포정위분석화대사통로부집분석.통과대분리획득적SJTD-1균주진행단백질조학분석,가위동록가단포균SJTD-1분해배완경이급SJTD-1재생물수복응용중적연구전정기출.
