江苏农业学报
江囌農業學報
강소농업학보
JIANGSU JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2015年
2期
394-400
,共7页
郭保平%牛亚茹%徐明龙%徐银学
郭保平%牛亞茹%徐明龍%徐銀學
곽보평%우아여%서명룡%서은학
AMHR2%AMHR2-SV1%新型转录本%表达图谱
AMHR2%AMHR2-SV1%新型轉錄本%錶達圖譜
AMHR2%AMHR2-SV1%신형전록본%표체도보
anti-Müllerian hormone receptor 2 (AMHR2)%AMHR2-SV1%novel transcript%expression profile
本研究旨在鉴定抗苗勒氏管激素受体2(AMHR2)一种新的转录本,确定其在大鼠组织中的表达情况.采用TRIzol法提取组织总RNA;运用RT-PCR和克隆测序技术分析AMHR2基因的可变剪接体及其在大鼠各组织器官中的表达差异,同时利用NCBI ORF Finder识别剪接体序列阅读框,运用ExPASy-ProtParam和Conserved domains软件分别预测剪接体氨基酸构成及其性质和剪接体保守序列.AMHR2-SV1是AMHR2的一种新型转录本,命名为AMHR2-splice variant(AMHR2-SV1),与AMHR2参考序列比较,缺失第10外显子137 bp.利用NCBI ORF Finder和ExPASy-ProtParam,预测AMHR2-SV1编码429个氨基酸残基,其编码的蛋白质分子量为45 990.7.Conserved domains在线软件分析表明:AMHR2-SV1蛋白序列比完整AMHR2蛋白序列缺少128个氨基酸,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶结构域不完整.检测结果表明,大鼠组织中均存在AMHR2和AMHR2-SV1两个转录本.在肝、脾、肺、肾、肾上腺和子宫组织中AMHR2表达量均高于AMHR2-SV1,差异达到显著水平;两种转录本在不同组织中表达趋势相同,卵巢中表达量最高,心脏中次之,其他组织表达量均显著低于卵巢和心脏.
本研究旨在鑒定抗苗勒氏管激素受體2(AMHR2)一種新的轉錄本,確定其在大鼠組織中的錶達情況.採用TRIzol法提取組織總RNA;運用RT-PCR和剋隆測序技術分析AMHR2基因的可變剪接體及其在大鼠各組織器官中的錶達差異,同時利用NCBI ORF Finder識彆剪接體序列閱讀框,運用ExPASy-ProtParam和Conserved domains軟件分彆預測剪接體氨基痠構成及其性質和剪接體保守序列.AMHR2-SV1是AMHR2的一種新型轉錄本,命名為AMHR2-splice variant(AMHR2-SV1),與AMHR2參攷序列比較,缺失第10外顯子137 bp.利用NCBI ORF Finder和ExPASy-ProtParam,預測AMHR2-SV1編碼429箇氨基痠殘基,其編碼的蛋白質分子量為45 990.7.Conserved domains在線軟件分析錶明:AMHR2-SV1蛋白序列比完整AMHR2蛋白序列缺少128箇氨基痠,絲氨痠/囌氨痠蛋白激酶結構域不完整.檢測結果錶明,大鼠組織中均存在AMHR2和AMHR2-SV1兩箇轉錄本.在肝、脾、肺、腎、腎上腺和子宮組織中AMHR2錶達量均高于AMHR2-SV1,差異達到顯著水平;兩種轉錄本在不同組織中錶達趨勢相同,卵巢中錶達量最高,心髒中次之,其他組織錶達量均顯著低于卵巢和心髒.
본연구지재감정항묘륵씨관격소수체2(AMHR2)일충신적전록본,학정기재대서조직중적표체정황.채용TRIzol법제취조직총RNA;운용RT-PCR화극륭측서기술분석AMHR2기인적가변전접체급기재대서각조직기관중적표체차이,동시이용NCBI ORF Finder식별전접체서렬열독광,운용ExPASy-ProtParam화Conserved domains연건분별예측전접체안기산구성급기성질화전접체보수서렬.AMHR2-SV1시AMHR2적일충신형전록본,명명위AMHR2-splice variant(AMHR2-SV1),여AMHR2삼고서렬비교,결실제10외현자137 bp.이용NCBI ORF Finder화ExPASy-ProtParam,예측AMHR2-SV1편마429개안기산잔기,기편마적단백질분자량위45 990.7.Conserved domains재선연건분석표명:AMHR2-SV1단백서렬비완정AMHR2단백서렬결소128개안기산,사안산/소안산단백격매결구역불완정.검측결과표명,대서조직중균존재AMHR2화AMHR2-SV1량개전록본.재간、비、폐、신、신상선화자궁조직중AMHR2표체량균고우AMHR2-SV1,차이체도현저수평;량충전록본재불동조직중표체추세상동,란소중표체량최고,심장중차지,기타조직표체량균현저저우란소화심장.