湖北农业科学
湖北農業科學
호북농업과학
2015年
3期
713-716,721
,共5页
希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum Sacc.)%磷脂酰肌醇转移蛋白质%生物信息学分析%遗传关系%炭疽菌属
希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum Sacc.)%燐脂酰肌醇轉移蛋白質%生物信息學分析%遺傳關繫%炭疽菌屬
희금사탄저균(Colletotrichum higginsanum Sacc.)%린지선기순전이단백질%생물신식학분석%유전관계%탄저균속
Colletotrichum higginsanum Sacc.%PITP%bioinformatics analysis%genetic relationship%Colletotrichum spp.
以酿酒酵母中已经报道的5个典型PITP序列为基础,对炭疽菌属蛋白质数据库进行Blastp比对以及关键词搜索,并通过SMART保守结构域分析,明确该菌含有4个典型的PITP;同时,通过对上述氨基酸序列进行疏水性、细胞信号肽、跨膜区结构域、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析,并与其他物种中15个同源序列进行遗传关系比较分析,以期为深入开展希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum Sacc.)PITP的功能研究打下理论基础,同时,也为进一步开展其他炭疽菌的研究提供重要的理论指导.
以釀酒酵母中已經報道的5箇典型PITP序列為基礎,對炭疽菌屬蛋白質數據庫進行Blastp比對以及關鍵詞搜索,併通過SMART保守結構域分析,明確該菌含有4箇典型的PITP;同時,通過對上述氨基痠序列進行疏水性、細胞信號肽、跨膜區結構域、亞細胞定位以及二級結構等生物信息學分析,併與其他物種中15箇同源序列進行遺傳關繫比較分析,以期為深入開展希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum Sacc.)PITP的功能研究打下理論基礎,同時,也為進一步開展其他炭疽菌的研究提供重要的理論指導.
이양주효모중이경보도적5개전형PITP서렬위기출,대탄저균속단백질수거고진행Blastp비대이급관건사수색,병통과SMART보수결구역분석,명학해균함유4개전형적PITP;동시,통과대상술안기산서렬진행소수성、세포신호태、과막구결구역、아세포정위이급이급결구등생물신식학분석,병여기타물충중15개동원서렬진행유전관계비교분석,이기위심입개전희금사탄저균(Colletotrichum higginsanum Sacc.)PITP적공능연구타하이론기출,동시,야위진일보개전기타탄저균적연구제공중요적이론지도.
