现代消化及介入诊疗
現代消化及介入診療
현대소화급개입진료
MODERN DIGESTION & INTERVENTION
2015年
1期
5-8
,共4页
胃癌%转录因子%转录调控网络
胃癌%轉錄因子%轉錄調控網絡
위암%전록인자%전록조공망락
Gastric cancer%Transcriptional factors%Transcriptional regulatory network
目的 筛选胃癌发生发展过程中的差异表达基因,构建差异调控网络.方法 在本文的研究中,我们从公共基因表达数据库(GEO数据库)中下载胃癌相关表达谱数据GSE2685的基因芯片(7个正常组织样本,23个胃癌组织样本),筛选胃癌和正常胃组织的差异基因(P＜ 0.05及差异值＞2或＜-2);计算差异基因与靶基因间的皮尔森相关系数(｜PCC｜＞0.75),构建差异调控网络;GO富集方法分析差异调控网络基因的功能.结果 在这个调控网络中,一些转录因子(TFs)和靶基因在之前的相关研究中已经被证实与胃癌相关.此外我们也发现一些新的转录因子和靶基因与胃癌相关.有效的整合以往的研究结果,让我们对应用转录调控网络识别胃癌相关基因的方法有了新的认识.结论 基于转录调控网络的方法识别胃癌相关基因具有很好的应用价值.
目的 篩選胃癌髮生髮展過程中的差異錶達基因,構建差異調控網絡.方法 在本文的研究中,我們從公共基因錶達數據庫(GEO數據庫)中下載胃癌相關錶達譜數據GSE2685的基因芯片(7箇正常組織樣本,23箇胃癌組織樣本),篩選胃癌和正常胃組織的差異基因(P＜ 0.05及差異值＞2或＜-2);計算差異基因與靶基因間的皮爾森相關繫數(｜PCC｜＞0.75),構建差異調控網絡;GO富集方法分析差異調控網絡基因的功能.結果 在這箇調控網絡中,一些轉錄因子(TFs)和靶基因在之前的相關研究中已經被證實與胃癌相關.此外我們也髮現一些新的轉錄因子和靶基因與胃癌相關.有效的整閤以往的研究結果,讓我們對應用轉錄調控網絡識彆胃癌相關基因的方法有瞭新的認識.結論 基于轉錄調控網絡的方法識彆胃癌相關基因具有很好的應用價值.
목적 사선위암발생발전과정중적차이표체기인,구건차이조공망락.방법 재본문적연구중,아문종공공기인표체수거고(GEO수거고)중하재위암상관표체보수거GSE2685적기인심편(7개정상조직양본,23개위암조직양본),사선위암화정상위조직적차이기인(P＜ 0.05급차이치＞2혹＜-2);계산차이기인여파기인간적피이삼상관계수(｜PCC｜＞0.75),구건차이조공망락;GO부집방법분석차이조공망락기인적공능.결과 재저개조공망락중,일사전록인자(TFs)화파기인재지전적상관연구중이경피증실여위암상관.차외아문야발현일사신적전록인자화파기인여위암상관.유효적정합이왕적연구결과,양아문대응용전록조공망락식별위암상관기인적방법유료신적인식.결론 기우전록조공망락적방법식별위암상관기인구유흔호적응용개치.
