重庆理工大学学报(自然科学版)
重慶理工大學學報(自然科學版)
중경리공대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF CHONGQING INSTITUTE OF TECHNOLOGY
2015年
5期
61-65
,共5页
王爱华%杨闫%刘欢%褚威威%于晓庆%李春
王愛華%楊閆%劉歡%褚威威%于曉慶%李春
왕애화%양염%류환%저위위%우효경%리춘
凋亡蛋白%亚细胞定位%氨基酸%最近邻方法
凋亡蛋白%亞細胞定位%氨基痠%最近鄰方法
조망단백%아세포정위%안기산%최근린방법
apoptosis proteins%subcellular location%amino acid%the nearest neighbor classifier
基于频率位置信息与频率本身相结合的思想,并结合氨基酸的分类模型、理化性质和替换矩阵构造了蛋白质序列的特征向量;以最近邻方法作为分类器,利用 ZW225和 CL317两个经典数据集对该方法进行了检验,所得结果同其他亚细胞定位预测方法做了比较。结果表明该方法是有效的。
基于頻率位置信息與頻率本身相結閤的思想,併結閤氨基痠的分類模型、理化性質和替換矩陣構造瞭蛋白質序列的特徵嚮量;以最近鄰方法作為分類器,利用 ZW225和 CL317兩箇經典數據集對該方法進行瞭檢驗,所得結果同其他亞細胞定位預測方法做瞭比較。結果錶明該方法是有效的。
기우빈솔위치신식여빈솔본신상결합적사상,병결합안기산적분류모형、이화성질화체환구진구조료단백질서렬적특정향량;이최근린방법작위분류기,이용 ZW225화 CL317량개경전수거집대해방법진행료검험,소득결과동기타아세포정위예측방법주료비교。결과표명해방법시유효적。
By means of the idea of combining the position information with the frequency itself and taking into account the classifications of the amino acids,physical chemical properties and the amino acid substitution matrix,the feature vector was constructed for a protein sequence. The nearest neigh-bor classifier was used as the prediction engine. We selected two widely used datasets(ZW225 and CL317)to provide a comprehensive and unbiased comparison with previous studies of protein subcel-lular location. The result shows that our method is effective.