安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2015年
16期
146-149
,共4页
尚延丽%冯霞%靳野%张晓霞%张柳%马军武
尚延麗%馮霞%靳野%張曉霞%張柳%馬軍武
상연려%풍하%근야%장효하%장류%마군무
口蹄疫病毒%结构蛋白VP1%H-2d限制性T细胞表位%生物信息学
口蹄疫病毒%結構蛋白VP1%H-2d限製性T細胞錶位%生物信息學
구제역병독%결구단백VP1%H-2d한제성T세포표위%생물신식학
FMDV%Structural protein VP1%H-2d restricted T cell epitopes%Bioinformatics
[目的]预测A型口蹄疫病毒结构蛋白VP1的H-2d限制性T细胞表位.[方法]使用多种在线表位预测软件,包括Syfpeithi、IEDB、NetMHC-3.2、IMTECH和BIMAS预测A型口蹄疫病毒VP1上可能有的H-2d限制性T细胞表位,然后用ProtParam软件分析预测出的候选袁位.[结果]综合比较5个表位预测软件的预测结果,遴选出10个候选表位;再结合ProtParam软件分析结果,最后共预测出5个表位:其中H-2Kd限制性表位有第27 ～35、118 ～126位,H-2Ld限制性表位有第43 ～51位,H-2Dd限制性表位有第45 ～ 53、146～154位.[结论]预测出5条口蹄疫病毒结构蛋白VP1 H-2d限制性CTL表位,为进一步鉴定口蹄疫病毒CTL表位提供数据和基础.
[目的]預測A型口蹄疫病毒結構蛋白VP1的H-2d限製性T細胞錶位.[方法]使用多種在線錶位預測軟件,包括Syfpeithi、IEDB、NetMHC-3.2、IMTECH和BIMAS預測A型口蹄疫病毒VP1上可能有的H-2d限製性T細胞錶位,然後用ProtParam軟件分析預測齣的候選袁位.[結果]綜閤比較5箇錶位預測軟件的預測結果,遴選齣10箇候選錶位;再結閤ProtParam軟件分析結果,最後共預測齣5箇錶位:其中H-2Kd限製性錶位有第27 ～35、118 ～126位,H-2Ld限製性錶位有第43 ～51位,H-2Dd限製性錶位有第45 ～ 53、146～154位.[結論]預測齣5條口蹄疫病毒結構蛋白VP1 H-2d限製性CTL錶位,為進一步鑒定口蹄疫病毒CTL錶位提供數據和基礎.
[목적]예측A형구제역병독결구단백VP1적H-2d한제성T세포표위.[방법]사용다충재선표위예측연건,포괄Syfpeithi、IEDB、NetMHC-3.2、IMTECH화BIMAS예측A형구제역병독VP1상가능유적H-2d한제성T세포표위,연후용ProtParam연건분석예측출적후선원위.[결과]종합비교5개표위예측연건적예측결과,린선출10개후선표위;재결합ProtParam연건분석결과,최후공예측출5개표위:기중H-2Kd한제성표위유제27 ～35、118 ～126위,H-2Ld한제성표위유제43 ～51위,H-2Dd한제성표위유제45 ～ 53、146～154위.[결론]예측출5조구제역병독결구단백VP1 H-2d한제성CTL표위,위진일보감정구제역병독CTL표위제공수거화기출.
