莆田学院学报
莆田學院學報
보전학원학보
JOURNAL OF PUTIAN UNIVERISTY
2015年
2期
40-43
,共4页
蛋白质功能%推荐算法%生物信息学%蛋白质序列%关联规则
蛋白質功能%推薦算法%生物信息學%蛋白質序列%關聯規則
단백질공능%추천산법%생물신식학%단백질서렬%관련규칙
采用一种基于关联规则与功能标签的推荐算法,对蛋白质功能进行预测.根据蛋白质序列的循环排列匹配关系,构建蛋白质相关联数据集;应用此数据集里已知蛋白质的功能标签,搜索蛋白质数据库,寻找与待预测蛋白质相似的已知蛋白质,进一步预测未知蛋白质的功能;最后,通过准确率、召回率以及F 1-measure三个指标来衡量结果,并对比传统的直接推荐注释方法,验证结果的有效性.
採用一種基于關聯規則與功能標籤的推薦算法,對蛋白質功能進行預測.根據蛋白質序列的循環排列匹配關繫,構建蛋白質相關聯數據集;應用此數據集裏已知蛋白質的功能標籤,搜索蛋白質數據庫,尋找與待預測蛋白質相似的已知蛋白質,進一步預測未知蛋白質的功能;最後,通過準確率、召迴率以及F 1-measure三箇指標來衡量結果,併對比傳統的直接推薦註釋方法,驗證結果的有效性.
채용일충기우관련규칙여공능표첨적추천산법,대단백질공능진행예측.근거단백질서렬적순배배렬필배관계,구건단백질상관련수거집;응용차수거집리이지단백질적공능표첨,수색단백질수거고,심조여대예측단백질상사적이지단백질,진일보예측미지단백질적공능;최후,통과준학솔、소회솔이급F 1-measure삼개지표래형량결과,병대비전통적직접추천주석방법,험증결과적유효성.
