热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2015年
5期
895-900
,共6页
橡胶树%磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶%cDNA%生物信息学分析%表达模式
橡膠樹%燐痠烯醇式丙酮痠羧化酶%cDNA%生物信息學分析%錶達模式
상효수%린산희순식병동산최화매%cDNA%생물신식학분석%표체모식
Hevea brasiliensis%Phosphoenolpyruvate carboxylase (PEPC)%cDNA%Bio-informatics analysis%Expression profiles
根据橡胶树磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因的部分序列设计引物,运用RT-PCR和RACE方法获得其家族成员的1个全长cDNA,命名为HbPPC1,长度3 025 bp,包含5'-UTR 34 bp,3'-UTR 93 bp,开放阅读框2 898bp,编码965个氨基酸.预测HbPPC1分子量为110.34 ku,理论等电点为6.09.HbPPC1具有C3型PEPC的结构特征,其N端第9～17位残基是可逆磷酸化的不变序列-X-X-SIDAQLR,C端倒数第4位残基为谷氨酰胺(Q),第774位残基为丙氨酸(A).HbPPC1与5条大戟科植物的PEPC序列(其中木薯2条、蓖麻2条、麻风树1条)的同源性达到95％.系统进化分析表明,HbPPC1与这5条序列聚在同一个进化支中.HbPPC1包含2个酶活性位点和7种类型的Motifs,二级结构以由α-螺旋和无规则卷曲为主.Real-time RT-PCR结果表明,HbPPC1在橡胶树胶乳、叶片、树皮和花中均表达,在胶乳中的表达量最高;胶乳HbPPC1的表达受乙烯利刺激影响,在乙烯利刺激4～72 h后胶乳HbPPC1表达明显下调,表明HbPPC1在胶乳pH值调控中起重要作用.本研究结果为HbPPC1的功能研究提供理论依据.
根據橡膠樹燐痠烯醇式丙酮痠羧化酶(PEPC)基因的部分序列設計引物,運用RT-PCR和RACE方法穫得其傢族成員的1箇全長cDNA,命名為HbPPC1,長度3 025 bp,包含5'-UTR 34 bp,3'-UTR 93 bp,開放閱讀框2 898bp,編碼965箇氨基痠.預測HbPPC1分子量為110.34 ku,理論等電點為6.09.HbPPC1具有C3型PEPC的結構特徵,其N耑第9～17位殘基是可逆燐痠化的不變序列-X-X-SIDAQLR,C耑倒數第4位殘基為穀氨酰胺(Q),第774位殘基為丙氨痠(A).HbPPC1與5條大戟科植物的PEPC序列(其中木藷2條、蓖痳2條、痳風樹1條)的同源性達到95％.繫統進化分析錶明,HbPPC1與這5條序列聚在同一箇進化支中.HbPPC1包含2箇酶活性位點和7種類型的Motifs,二級結構以由α-螺鏇和無規則捲麯為主.Real-time RT-PCR結果錶明,HbPPC1在橡膠樹膠乳、葉片、樹皮和花中均錶達,在膠乳中的錶達量最高;膠乳HbPPC1的錶達受乙烯利刺激影響,在乙烯利刺激4～72 h後膠乳HbPPC1錶達明顯下調,錶明HbPPC1在膠乳pH值調控中起重要作用.本研究結果為HbPPC1的功能研究提供理論依據.
근거상효수린산희순식병동산최화매(PEPC)기인적부분서렬설계인물,운용RT-PCR화RACE방법획득기가족성원적1개전장cDNA,명명위HbPPC1,장도3 025 bp,포함5'-UTR 34 bp,3'-UTR 93 bp,개방열독광2 898bp,편마965개안기산.예측HbPPC1분자량위110.34 ku,이론등전점위6.09.HbPPC1구유C3형PEPC적결구특정,기N단제9～17위잔기시가역린산화적불변서렬-X-X-SIDAQLR,C단도수제4위잔기위곡안선알(Q),제774위잔기위병안산(A).HbPPC1여5조대극과식물적PEPC서렬(기중목서2조、비마2조、마풍수1조)적동원성체도95％.계통진화분석표명,HbPPC1여저5조서렬취재동일개진화지중.HbPPC1포함2개매활성위점화7충류형적Motifs,이급결구이유α-라선화무규칙권곡위주.Real-time RT-PCR결과표명,HbPPC1재상효수효유、협편、수피화화중균표체,재효유중적표체량최고;효유HbPPC1적표체수을희리자격영향,재을희리자격4～72 h후효유HbPPC1표체명현하조,표명HbPPC1재효유pH치조공중기중요작용.본연구결과위HbPPC1적공능연구제공이론의거.
