中国草地学报
中國草地學報
중국초지학보
CHINESE JOURNAL OF GRASSLAND
2015年
3期
11-18
,共8页
崔喜艳%张继伟%秦思余%刘忠野%郭继勋
崔喜豔%張繼偉%秦思餘%劉忠野%郭繼勛
최희염%장계위%진사여%류충야%곽계훈
羊草%CDPK基因%生物信息学%基因表达
羊草%CDPK基因%生物信息學%基因錶達
양초%CDPK기인%생물신식학%기인표체
Leymus chinensis%CDPK gene%Bioinformatics%Gene expression
为了研究钙依赖型蛋白激酶(CDPK)在羊草适应生境中的功能,分别对羊草幼苗进行模拟干旱(PEG)和盐碱(NaCl-Na2 CO3)处理,测序分析了羊草中克隆的CDPK基因cDNA(LcCDPK),其核酸序列全长为1704 bp,开放阅读框为1647 bp,共编码548个氨基酸,编码的氨基酸序列与GenBank中小麦CDPK1基因的同源性最高,氨基酸一致性为96％.用软件对其蛋白质氨基酸组成及结构分析,氨基酸序列构成具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶催化活性的S-TKc结构域,有4个保守的EF手性结构域,为Ca2+结合位点,预测的成熟肽相对分子质量61.349KDa,理论等电点5.34;二级结构预测α-螺旋占37.59％,β-折叠占9.85％,而无规则卷曲占52.55％;实时荧光定量PCR结果分析表明,在低浓度PEG、盐碱处理条件下羊草根及叶片的CDPK基因表达下调,高浓度处理条件下CDPK基因表达上调,说明CDPK基因表达受干旱及盐碱胁迫调控;盐碱处理条件下CDPK基因在根和叶片中的表达均高于干旱处理.推测LcCDPK广泛参与羊草抵御逆境胁迫的响应,尤其在盐碱胁迫过程中发挥重要作用.
為瞭研究鈣依賴型蛋白激酶(CDPK)在羊草適應生境中的功能,分彆對羊草幼苗進行模擬榦旱(PEG)和鹽堿(NaCl-Na2 CO3)處理,測序分析瞭羊草中剋隆的CDPK基因cDNA(LcCDPK),其覈痠序列全長為1704 bp,開放閱讀框為1647 bp,共編碼548箇氨基痠,編碼的氨基痠序列與GenBank中小麥CDPK1基因的同源性最高,氨基痠一緻性為96％.用軟件對其蛋白質氨基痠組成及結構分析,氨基痠序列構成具有絲氨痠/囌氨痠蛋白激酶催化活性的S-TKc結構域,有4箇保守的EF手性結構域,為Ca2+結閤位點,預測的成熟肽相對分子質量61.349KDa,理論等電點5.34;二級結構預測α-螺鏇佔37.59％,β-摺疊佔9.85％,而無規則捲麯佔52.55％;實時熒光定量PCR結果分析錶明,在低濃度PEG、鹽堿處理條件下羊草根及葉片的CDPK基因錶達下調,高濃度處理條件下CDPK基因錶達上調,說明CDPK基因錶達受榦旱及鹽堿脅迫調控;鹽堿處理條件下CDPK基因在根和葉片中的錶達均高于榦旱處理.推測LcCDPK廣汎參與羊草牴禦逆境脅迫的響應,尤其在鹽堿脅迫過程中髮揮重要作用.
위료연구개의뢰형단백격매(CDPK)재양초괄응생경중적공능,분별대양초유묘진행모의간한(PEG)화염감(NaCl-Na2 CO3)처리,측서분석료양초중극륭적CDPK기인cDNA(LcCDPK),기핵산서렬전장위1704 bp,개방열독광위1647 bp,공편마548개안기산,편마적안기산서렬여GenBank중소맥CDPK1기인적동원성최고,안기산일치성위96％.용연건대기단백질안기산조성급결구분석,안기산서렬구성구유사안산/소안산단백격매최화활성적S-TKc결구역,유4개보수적EF수성결구역,위Ca2+결합위점,예측적성숙태상대분자질량61.349KDa,이론등전점5.34;이급결구예측α-라선점37.59％,β-절첩점9.85％,이무규칙권곡점52.55％;실시형광정량PCR결과분석표명,재저농도PEG、염감처리조건하양초근급협편적CDPK기인표체하조,고농도처리조건하CDPK기인표체상조,설명CDPK기인표체수간한급염감협박조공;염감처리조건하CDPK기인재근화협편중적표체균고우간한처리.추측LcCDPK엄범삼여양초저어역경협박적향응,우기재염감협박과정중발휘중요작용.
