浙江农业学报
浙江農業學報
절강농업학보
ACTA AGRICULTURAE ZHEJIANGENSIS
2015年
5期
734-739
,共6页
王同淑%李传峰%陈宗艳%孟春春%吴润%刘光清
王同淑%李傳峰%陳宗豔%孟春春%吳潤%劉光清
왕동숙%리전봉%진종염%맹춘춘%오윤%류광청
鸭%RIG-Ⅰ%克隆%生物信息学分析%进化树
鴨%RIG-Ⅰ%剋隆%生物信息學分析%進化樹
압%RIG-Ⅰ%극륭%생물신식학분석%진화수
duck%RIG-Ⅰ%cloning%bioinformatics analysis%phylogenetic tree
应用RT-PCR方法,从北京鸭组织中扩增维甲酸诱导基因Ⅰ(rerinotic acid inducible gene Ⅰ,RIG-Ⅰ),用DNA Star等生物软件分析其所含的生物信息,并构建系统进化树.扩增出的北京鸭RIG-Ⅰ基因(GenBank登录号:KM455977)全长2 802 bp,编码933个氨基酸.RIG-Ⅰ具有RLR家族的典型特征,即N端含两个半胱天冬酶活化和募集结构域,C端包括RNA解旋酶,ATP结合结构域,RNA结合结构域和抑制结构域,RIG-Ⅰ蛋白二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主.序列比对和系统进化分析结果表明,RIG-Ⅰ的序列在同种之间比较保守,与已报道的鸭RIG-Ⅰ的同源性高达98％以上;但与鹅RIG-Ⅰ同源性稍低,为95.9％;与人、鼠、草鱼的同源性较低,分别为62.3％,61.5％,61.2％;与猪的同源性最低,仅为54.4％.成功克隆了鸭的RIG-Ⅰ基因,可为今后开展鸭的天然免疫研究及研发新型疫苗等奠定基础.
應用RT-PCR方法,從北京鴨組織中擴增維甲痠誘導基因Ⅰ(rerinotic acid inducible gene Ⅰ,RIG-Ⅰ),用DNA Star等生物軟件分析其所含的生物信息,併構建繫統進化樹.擴增齣的北京鴨RIG-Ⅰ基因(GenBank登錄號:KM455977)全長2 802 bp,編碼933箇氨基痠.RIG-Ⅰ具有RLR傢族的典型特徵,即N耑含兩箇半胱天鼕酶活化和募集結構域,C耑包括RNA解鏇酶,ATP結閤結構域,RNA結閤結構域和抑製結構域,RIG-Ⅰ蛋白二級結構以無規則捲麯和α-螺鏇為主.序列比對和繫統進化分析結果錶明,RIG-Ⅰ的序列在同種之間比較保守,與已報道的鴨RIG-Ⅰ的同源性高達98％以上;但與鵝RIG-Ⅰ同源性稍低,為95.9％;與人、鼠、草魚的同源性較低,分彆為62.3％,61.5％,61.2％;與豬的同源性最低,僅為54.4％.成功剋隆瞭鴨的RIG-Ⅰ基因,可為今後開展鴨的天然免疫研究及研髮新型疫苗等奠定基礎.
응용RT-PCR방법,종북경압조직중확증유갑산유도기인Ⅰ(rerinotic acid inducible gene Ⅰ,RIG-Ⅰ),용DNA Star등생물연건분석기소함적생물신식,병구건계통진화수.확증출적북경압RIG-Ⅰ기인(GenBank등록호:KM455977)전장2 802 bp,편마933개안기산.RIG-Ⅰ구유RLR가족적전형특정,즉N단함량개반광천동매활화화모집결구역,C단포괄RNA해선매,ATP결합결구역,RNA결합결구역화억제결구역,RIG-Ⅰ단백이급결구이무규칙권곡화α-라선위주.서렬비대화계통진화분석결과표명,RIG-Ⅰ적서렬재동충지간비교보수,여이보도적압RIG-Ⅰ적동원성고체98％이상;단여아RIG-Ⅰ동원성초저,위95.9％;여인、서、초어적동원성교저,분별위62.3％,61.5％,61.2％;여저적동원성최저,부위54.4％.성공극륭료압적RIG-Ⅰ기인,가위금후개전압적천연면역연구급연발신형역묘등전정기출.
