南京工业大学学报（自然科学版）
南京工業大學學報（自然科學版）
남경공업대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF NANJING UNIVERSITY OF TECHNOLOGY(NATURAL SCIENCE EDITION)
2015年
3期
120-124
,共5页
顾勇亮%董珂珂%王伟%朱小蕾
顧勇亮%董珂珂%王偉%硃小蕾
고용량%동가가%왕위%주소뢰
分子动力学模拟%MM-PBSA方法%二肽基肽酶-4%氰基吡咯烷抑制剂
分子動力學模擬%MM-PBSA方法%二肽基肽酶-4%氰基吡咯烷抑製劑
분자동역학모의%MM-PBSA방법%이태기태매-4%청기필각완억제제
molecular dynamics simulation%MM-PBSA method%DPP-4%cyanopyrrolidine inhibitor
通过分子对接、分子动力学(MD)模拟和自由能分析的方法研究3种氰基吡咯烷抑制剂与二肽基肽酶-4(DPP-4)之间的成键机制,分析和讨论3种抑制剂与二肽基肽酶之间的静电相互作用、范德华相互作用.用MM-PBSA方法计算得到的3种抑制剂的结合自由能与实验测得的结果是一致的.抑制剂与残基所形成的氢键能够使抑制剂稳定在结合位点.由残基Tyr631和Tyr666与抑制剂形成的范德华相互作用对结合自由能起到关键作用,并且显著地将3种不同抑制剂的生物活性区分开来.
通過分子對接、分子動力學(MD)模擬和自由能分析的方法研究3種氰基吡咯烷抑製劑與二肽基肽酶-4(DPP-4)之間的成鍵機製,分析和討論3種抑製劑與二肽基肽酶之間的靜電相互作用、範德華相互作用.用MM-PBSA方法計算得到的3種抑製劑的結閤自由能與實驗測得的結果是一緻的.抑製劑與殘基所形成的氫鍵能夠使抑製劑穩定在結閤位點.由殘基Tyr631和Tyr666與抑製劑形成的範德華相互作用對結閤自由能起到關鍵作用,併且顯著地將3種不同抑製劑的生物活性區分開來.
통과분자대접、분자동역학(MD)모의화자유능분석적방법연구3충청기필각완억제제여이태기태매-4(DPP-4)지간적성건궤제,분석화토론3충억제제여이태기태매지간적정전상호작용、범덕화상호작용.용MM-PBSA방법계산득도적3충억제제적결합자유능여실험측득적결과시일치적.억제제여잔기소형성적경건능구사억제제은정재결합위점.유잔기Tyr631화Tyr666여억제제형성적범덕화상호작용대결합자유능기도관건작용,병차현저지장3충불동억제제적생물활성구분개래.
