湖北农业科学
湖北農業科學
호북농업과학
2015年
6期
1416-1420,1433
,共6页
周明亮%杨平贵%吴登俊%张翔宇
週明亮%楊平貴%吳登俊%張翔宇
주명량%양평귀%오등준%장상우
绵羊%IGFBP-7基因%克隆%序列分析
綿羊%IGFBP-7基因%剋隆%序列分析
면양%IGFBP-7기인%극륭%서렬분석
sheep%insulin growth factor binding protein-7 gene(IGFBP-7 gene)%clone%sequence analysis
试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了其IGFBP-7基因的CDS全序列,生物信息学方法深入分析其序列.结果表明,凉山半细毛羊IGFBP-7基因的CDS序列为846 bp,编码282个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为99％、95％、90％,氨基酸序列同源性分别为98％、93％、89％,GenBank登录号为FJ589640.1;IGFBP-7基因的氨基酸分子质量为29.0 ku,理论等电点(pI)为8.25;进化分析显示其与牛、山羊等哺乳动物关系较近,与斑马鱼、鲍等亲缘关系较远;IGFBP-7基因的蛋白质疏水性区域与亲水性区域间隔较为均匀分布,有1个信号肽、2个跨膜区、16个磷酸化位点、4个N-糖基化位点和1个O-糖基化位点;二级结构分析显示无规卷曲、α-螺旋和B-折叠区域分别为64.89％、19.86％、15.25％;三级结构分析显示存在IGFBP N和Ig-like功能域.该试验为进一步研究绵羊IGFBP-7基因的功能奠定了基础.
試驗以涼山半細毛羊為研究對象,採用RT-PCR方法剋隆瞭其IGFBP-7基因的CDS全序列,生物信息學方法深入分析其序列.結果錶明,涼山半細毛羊IGFBP-7基因的CDS序列為846 bp,編碼282箇氨基痠,與牛、人、鼠的CDS同源性分彆為99％、95％、90％,氨基痠序列同源性分彆為98％、93％、89％,GenBank登錄號為FJ589640.1;IGFBP-7基因的氨基痠分子質量為29.0 ku,理論等電點(pI)為8.25;進化分析顯示其與牛、山羊等哺乳動物關繫較近,與斑馬魚、鮑等親緣關繫較遠;IGFBP-7基因的蛋白質疏水性區域與親水性區域間隔較為均勻分佈,有1箇信號肽、2箇跨膜區、16箇燐痠化位點、4箇N-糖基化位點和1箇O-糖基化位點;二級結構分析顯示無規捲麯、α-螺鏇和B-摺疊區域分彆為64.89％、19.86％、15.25％;三級結構分析顯示存在IGFBP N和Ig-like功能域.該試驗為進一步研究綿羊IGFBP-7基因的功能奠定瞭基礎.
시험이량산반세모양위연구대상,채용RT-PCR방법극륭료기IGFBP-7기인적CDS전서렬,생물신식학방법심입분석기서렬.결과표명,량산반세모양IGFBP-7기인적CDS서렬위846 bp,편마282개안기산,여우、인、서적CDS동원성분별위99％、95％、90％,안기산서렬동원성분별위98％、93％、89％,GenBank등록호위FJ589640.1;IGFBP-7기인적안기산분자질량위29.0 ku,이론등전점(pI)위8.25;진화분석현시기여우、산양등포유동물관계교근,여반마어、포등친연관계교원;IGFBP-7기인적단백질소수성구역여친수성구역간격교위균균분포,유1개신호태、2개과막구、16개린산화위점、4개N-당기화위점화1개O-당기화위점;이급결구분석현시무규권곡、α-라선화B-절첩구역분별위64.89％、19.86％、15.25％;삼급결구분석현시존재IGFBP N화Ig-like공능역.해시험위진일보연구면양IGFBP-7기인적공능전정료기출.
