山东医药
山東醫藥
산동의약
SHANDONG MEDICAL JOURNAL
2014年
9期
42-43,61
,共3页
孙丽岩%李珺%王泳
孫麗巖%李珺%王泳
손려암%리군%왕영
2型糖尿病%胰腺肿瘤%生物信息学%基因表达谱
2型糖尿病%胰腺腫瘤%生物信息學%基因錶達譜
2형당뇨병%이선종류%생물신식학%기인표체보
目的:用生物信息学方法研究2型糖尿病与胰腺癌之间的关系。方法在基因表达汇编数据库中分别下载2型糖尿病的基因表达谱及其对照,以及胰腺癌的基因表达谱及其对照。使用R语言中的Limma方法筛选差异基因;用在线服务器DAVID富集通路;将最终结果进行比较。结果2型糖尿病筛选出上调基因416个,下调基因348个(P均<0.05);胰腺癌筛选出上调基因778个,下调基因129个(P均<0.05)。2型糖尿病上调的差异基因所富集到的通路与胰腺癌上调的差异基因所富集到的通路相同的有3条,分别为癌症通路、轴突导向通路和小细胞肺癌通路,共有一个基因ENTREZ_GENE_ID:3845。在轴突导向通路中,共有Nras ( ENTREZ_GENE_ID:4893)和Kras(ENTREZ_GENE_ID:3845)基因。下调的基因所富集到的通路相同的有ECM-受体相互作用和局部粘连。结论在生物学角度上证明了2型糖尿病患者更容易患胰腺癌。
目的:用生物信息學方法研究2型糖尿病與胰腺癌之間的關繫。方法在基因錶達彙編數據庫中分彆下載2型糖尿病的基因錶達譜及其對照,以及胰腺癌的基因錶達譜及其對照。使用R語言中的Limma方法篩選差異基因;用在線服務器DAVID富集通路;將最終結果進行比較。結果2型糖尿病篩選齣上調基因416箇,下調基因348箇(P均<0.05);胰腺癌篩選齣上調基因778箇,下調基因129箇(P均<0.05)。2型糖尿病上調的差異基因所富集到的通路與胰腺癌上調的差異基因所富集到的通路相同的有3條,分彆為癌癥通路、軸突導嚮通路和小細胞肺癌通路,共有一箇基因ENTREZ_GENE_ID:3845。在軸突導嚮通路中,共有Nras ( ENTREZ_GENE_ID:4893)和Kras(ENTREZ_GENE_ID:3845)基因。下調的基因所富集到的通路相同的有ECM-受體相互作用和跼部粘連。結論在生物學角度上證明瞭2型糖尿病患者更容易患胰腺癌。
목적:용생물신식학방법연구2형당뇨병여이선암지간적관계。방법재기인표체회편수거고중분별하재2형당뇨병적기인표체보급기대조,이급이선암적기인표체보급기대조。사용R어언중적Limma방법사선차이기인;용재선복무기DAVID부집통로;장최종결과진행비교。결과2형당뇨병사선출상조기인416개,하조기인348개(P균<0.05);이선암사선출상조기인778개,하조기인129개(P균<0.05)。2형당뇨병상조적차이기인소부집도적통로여이선암상조적차이기인소부집도적통로상동적유3조,분별위암증통로、축돌도향통로화소세포폐암통로,공유일개기인ENTREZ_GENE_ID:3845。재축돌도향통로중,공유Nras ( ENTREZ_GENE_ID:4893)화Kras(ENTREZ_GENE_ID:3845)기인。하조적기인소부집도적통로상동적유ECM-수체상호작용화국부점련。결론재생물학각도상증명료2형당뇨병환자경용역환이선암。