中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2015年
5期
395-398
,共4页
张翠彩%徐建民%李秀文%曹志强%蒋秀高
張翠綵%徐建民%李秀文%曹誌彊%蔣秀高
장취채%서건민%리수문%조지강%장수고
钩端螺旋体%黄疸出血群%基因分型%MLST
鉤耑螺鏇體%黃疸齣血群%基因分型%MLST
구단라선체%황달출혈군%기인분형%MLST
Leptospira interrogans%serogroup Icterohaemorrhag%genotyping%MLST
目的 初步探讨MLST(multilocus sequence typing)分型技术在致病性钩端螺旋体中的应用.方法 对我国3个省份的39株致病性钩端螺旋体黄疸出血群菌株提取DNA,采用7个位点进行PCR扩增、序列测定,应用eBURST和BioNumerics (Version5.10)软件进行分析.结果 39株菌株呈现5个ST型别,ST1为中国三省份中主要的基因型,占53.85%(21/39).eBURST分析显示:39株菌株分为2个Clonal complexes和1个singleton,其中Group1占66.67%(26/39),Group2占20.51%(8/39),一个singleton占12.82% (5/39);BioNumerics软件聚类分析显示:39株菌株分为3个Group,与eBURST分析中的分群结构一致.MLST基因型别具有明显的地域性特征.结论 MLST方法可初步应用于致病性钩端螺旋体分子流行病学、种群结构、亲缘进化关系等研究.
目的 初步探討MLST(multilocus sequence typing)分型技術在緻病性鉤耑螺鏇體中的應用.方法 對我國3箇省份的39株緻病性鉤耑螺鏇體黃疸齣血群菌株提取DNA,採用7箇位點進行PCR擴增、序列測定,應用eBURST和BioNumerics (Version5.10)軟件進行分析.結果 39株菌株呈現5箇ST型彆,ST1為中國三省份中主要的基因型,佔53.85%(21/39).eBURST分析顯示:39株菌株分為2箇Clonal complexes和1箇singleton,其中Group1佔66.67%(26/39),Group2佔20.51%(8/39),一箇singleton佔12.82% (5/39);BioNumerics軟件聚類分析顯示:39株菌株分為3箇Group,與eBURST分析中的分群結構一緻.MLST基因型彆具有明顯的地域性特徵.結論 MLST方法可初步應用于緻病性鉤耑螺鏇體分子流行病學、種群結構、親緣進化關繫等研究.
목적 초보탐토MLST(multilocus sequence typing)분형기술재치병성구단라선체중적응용.방법 대아국3개성빈적39주치병성구단라선체황달출혈군균주제취DNA,채용7개위점진행PCR확증、서렬측정,응용eBURST화BioNumerics (Version5.10)연건진행분석.결과 39주균주정현5개ST형별,ST1위중국삼성빈중주요적기인형,점53.85%(21/39).eBURST분석현시:39주균주분위2개Clonal complexes화1개singleton,기중Group1점66.67%(26/39),Group2점20.51%(8/39),일개singleton점12.82% (5/39);BioNumerics연건취류분석현시:39주균주분위3개Group,여eBURST분석중적분군결구일치.MLST기인형별구유명현적지역성특정.결론 MLST방법가초보응용우치병성구단라선체분자류행병학、충군결구、친연진화관계등연구.