西北植物学报
西北植物學報
서북식물학보
ACTA BOTANICA BOREALI-OCCIDENTALIA SINICA
2015年
5期
853-864
,共12页
冯新%徐蕾%赖恭梯%谢晓清%林玉玲%赖钟雄
馮新%徐蕾%賴恭梯%謝曉清%林玉玲%賴鐘雄
풍신%서뢰%뢰공제%사효청%림옥령%뢰종웅
福州野生蕉%FeSOD家族基因%可变剪接%低温胁迫%基因表达
福州野生蕉%FeSOD傢族基因%可變剪接%低溫脅迫%基因錶達
복주야생초%FeSOD가족기인%가변전접%저온협박%기인표체
wild banana in Fuzhou%FeSOD family genes%alternative splicing%cold stress%gene expression
以抗寒性较强的福州野生蕉为材料,采用RACE和RT-PCR扩增得到铁超氧化物歧化酶(FeSOD)家族基因(FeSOD)的2个成员共4条转录本,分别命名为MuFSD1A(登录号JX844026)、MuFSD1B(登录号KJ786318)、MuFSD1B-variant1(登录号KJ786319)和MuFSD1B-varia nt2(登录号KJ786320).MuFSD1A基因cDNA全长为1 277 bp,编码300个氨基酸;MuFSD1B基因cDNA全长为1 378 bp,编码260个氨基酸.基因结构分析表明MuFSD1B-variant1和MuFSD1B-variant2为MuFSD1B的可变剪接转录本.生物信息学和亚细胞定位分析显示,MuFSD1A和MuFSD1B主要定位于叶绿体,但他们的理化性质、磷酸化位点、蛋白结构等存在差异.序列比对分析发现MuFSD1A和MuFSD1B相似性仅为33.33％,但都具有保守的金属结合位点和FeSOD的特征氨基酸.进化树分析显示,MuFSD1A和MuFSD1B聚在不同的分支中.qRT-PCR分析表明,低温诱导MuFSD1A基因的表达而抑制MuFSD1B基因的表达,且MuFSD1A基因的相对表达量随着温度的降低而显著增加,说明该成员可能在香蕉抗寒中起主要作用.
以抗寒性較彊的福州野生蕉為材料,採用RACE和RT-PCR擴增得到鐵超氧化物歧化酶(FeSOD)傢族基因(FeSOD)的2箇成員共4條轉錄本,分彆命名為MuFSD1A(登錄號JX844026)、MuFSD1B(登錄號KJ786318)、MuFSD1B-variant1(登錄號KJ786319)和MuFSD1B-varia nt2(登錄號KJ786320).MuFSD1A基因cDNA全長為1 277 bp,編碼300箇氨基痠;MuFSD1B基因cDNA全長為1 378 bp,編碼260箇氨基痠.基因結構分析錶明MuFSD1B-variant1和MuFSD1B-variant2為MuFSD1B的可變剪接轉錄本.生物信息學和亞細胞定位分析顯示,MuFSD1A和MuFSD1B主要定位于葉綠體,但他們的理化性質、燐痠化位點、蛋白結構等存在差異.序列比對分析髮現MuFSD1A和MuFSD1B相似性僅為33.33％,但都具有保守的金屬結閤位點和FeSOD的特徵氨基痠.進化樹分析顯示,MuFSD1A和MuFSD1B聚在不同的分支中.qRT-PCR分析錶明,低溫誘導MuFSD1A基因的錶達而抑製MuFSD1B基因的錶達,且MuFSD1A基因的相對錶達量隨著溫度的降低而顯著增加,說明該成員可能在香蕉抗寒中起主要作用.
이항한성교강적복주야생초위재료,채용RACE화RT-PCR확증득도철초양화물기화매(FeSOD)가족기인(FeSOD)적2개성원공4조전록본,분별명명위MuFSD1A(등록호JX844026)、MuFSD1B(등록호KJ786318)、MuFSD1B-variant1(등록호KJ786319)화MuFSD1B-varia nt2(등록호KJ786320).MuFSD1A기인cDNA전장위1 277 bp,편마300개안기산;MuFSD1B기인cDNA전장위1 378 bp,편마260개안기산.기인결구분석표명MuFSD1B-variant1화MuFSD1B-variant2위MuFSD1B적가변전접전록본.생물신식학화아세포정위분석현시,MuFSD1A화MuFSD1B주요정위우협록체,단타문적이화성질、린산화위점、단백결구등존재차이.서렬비대분석발현MuFSD1A화MuFSD1B상사성부위33.33％,단도구유보수적금속결합위점화FeSOD적특정안기산.진화수분석현시,MuFSD1A화MuFSD1B취재불동적분지중.qRT-PCR분석표명,저온유도MuFSD1A기인적표체이억제MuFSD1B기인적표체,차MuFSD1A기인적상대표체량수착온도적강저이현저증가,설명해성원가능재향초항한중기주요작용.
