湖北农业科学
湖北農業科學
호북농업과학
2015年
7期
1751-1754
,共4页
陈建兴%孙玉江%潘庆杰%陈海伟%赵冰%李冰
陳建興%孫玉江%潘慶傑%陳海偉%趙冰%李冰
진건흥%손옥강%반경걸%진해위%조빙%리빙
驴(Equus asinus)%生长激素%生物信息分析%密码子使用偏好
驢(Equus asinus)%生長激素%生物信息分析%密碼子使用偏好
려(Equus asinus)%생장격소%생물신식분석%밀마자사용편호
donkey(Equus asinus)%growth hormone%bioinformatic analysis%bias of codon usage
通过对驴(Equus asinus)GH基因序列进行生物信息学分析,结果表明,驴GH基因共包含5个外显子和4个内含子.5个外显子连接形成651 nt的CDS区序列,整个CDS区翻译出216个氨基酸构成的多肽.驴GH基因编码的216个氨基酸中,大多数氨基酸为亲水性氨基酸.原始肽链的前20多个氨基酸序列出现一个典型的疏水峰,为该原始肽链的信号肽片段.驴的GH基因中的氨基酸以亮氨酸所占的比例最高(13.89％,共出现30次),其次为丙氨酸(10.19％,共出现22次),最低的为色氨酸(0.93％,共出现2次).驴生长激素的编码存在明显的密码子使用偏好.
通過對驢(Equus asinus)GH基因序列進行生物信息學分析,結果錶明,驢GH基因共包含5箇外顯子和4箇內含子.5箇外顯子連接形成651 nt的CDS區序列,整箇CDS區翻譯齣216箇氨基痠構成的多肽.驢GH基因編碼的216箇氨基痠中,大多數氨基痠為親水性氨基痠.原始肽鏈的前20多箇氨基痠序列齣現一箇典型的疏水峰,為該原始肽鏈的信號肽片段.驢的GH基因中的氨基痠以亮氨痠所佔的比例最高(13.89％,共齣現30次),其次為丙氨痠(10.19％,共齣現22次),最低的為色氨痠(0.93％,共齣現2次).驢生長激素的編碼存在明顯的密碼子使用偏好.
통과대려(Equus asinus)GH기인서렬진행생물신식학분석,결과표명,려GH기인공포함5개외현자화4개내함자.5개외현자련접형성651 nt적CDS구서렬,정개CDS구번역출216개안기산구성적다태.려GH기인편마적216개안기산중,대다수안기산위친수성안기산.원시태련적전20다개안기산서렬출현일개전형적소수봉,위해원시태련적신호태편단.려적GH기인중적안기산이량안산소점적비례최고(13.89％,공출현30차),기차위병안산(10.19％,공출현22차),최저적위색안산(0.93％,공출현2차).려생장격소적편마존재명현적밀마자사용편호.
