东北农业大学学报
東北農業大學學報
동북농업대학학보
JOURNAL OF NORTHEAST AGRICULTURAL UNIVERSITY
2015年
5期
38-43,74
,共7页
李广兴%丛培君%潘龙%马玲%冯俪%黄艺华%任玉东%黄小丹
李廣興%叢培君%潘龍%馬玲%馮儷%黃藝華%任玉東%黃小丹
리엄흥%총배군%반룡%마령%풍려%황예화%임옥동%황소단
鸡堆型艾美尔球虫%3-1E蛋白%抗原表位%生物信息学
鷄堆型艾美爾毬蟲%3-1E蛋白%抗原錶位%生物信息學
계퇴형애미이구충%3-1E단백%항원표위%생물신식학
chicken Eimeria acervulina%3-1E protein%antigen epitope%bioinformatics
应用生物信息学分析和预测鸡堆型艾美尔球虫3-1E蛋白二级结构和抗原表位,为确定和筛选优势表位,研制安全、高效表位疫苗奠定基础.以克隆获得的鸡堆型艾美尔球虫3-1E蛋白氨基酸一级结构为基础,采用DNAStar软件和生物信息学在线分析程序ProtParam、SOSUI、IEDB、SYFPEITHI等预测3-1E蛋白理化性质和二级结构,并分析其序列跨膜区、可溶性、亲水性、可及性、柔韧性参数以及抗原指数,预测B细胞表位和T细胞表位的可能区域.3-1E蛋白由170个氨基酸组成,分子式C818H1257N213O272S3,分子质量18.5234 ku,理论等电点为4.25,半衰期为10h;无跨膜区均为膜外区,是一种可溶性蛋白.其二级结构中α螺旋占31.76％,β转角为12.35％.B细胞表位预测区域:44-49、65-67、86-87、111-116;分值较高的T细胞表位区域:52-60、94-102、97-105、154-162、157-165.运用生物信息学方法确定3-1E存在多个抗原表位,对进一步研究3-1E的抗原性和研发优势表位疫苗具有重要意义.
應用生物信息學分析和預測鷄堆型艾美爾毬蟲3-1E蛋白二級結構和抗原錶位,為確定和篩選優勢錶位,研製安全、高效錶位疫苗奠定基礎.以剋隆穫得的鷄堆型艾美爾毬蟲3-1E蛋白氨基痠一級結構為基礎,採用DNAStar軟件和生物信息學在線分析程序ProtParam、SOSUI、IEDB、SYFPEITHI等預測3-1E蛋白理化性質和二級結構,併分析其序列跨膜區、可溶性、親水性、可及性、柔韌性參數以及抗原指數,預測B細胞錶位和T細胞錶位的可能區域.3-1E蛋白由170箇氨基痠組成,分子式C818H1257N213O272S3,分子質量18.5234 ku,理論等電點為4.25,半衰期為10h;無跨膜區均為膜外區,是一種可溶性蛋白.其二級結構中α螺鏇佔31.76％,β轉角為12.35％.B細胞錶位預測區域:44-49、65-67、86-87、111-116;分值較高的T細胞錶位區域:52-60、94-102、97-105、154-162、157-165.運用生物信息學方法確定3-1E存在多箇抗原錶位,對進一步研究3-1E的抗原性和研髮優勢錶位疫苗具有重要意義.
응용생물신식학분석화예측계퇴형애미이구충3-1E단백이급결구화항원표위,위학정화사선우세표위,연제안전、고효표위역묘전정기출.이극륭획득적계퇴형애미이구충3-1E단백안기산일급결구위기출,채용DNAStar연건화생물신식학재선분석정서ProtParam、SOSUI、IEDB、SYFPEITHI등예측3-1E단백이화성질화이급결구,병분석기서렬과막구、가용성、친수성、가급성、유인성삼수이급항원지수,예측B세포표위화T세포표위적가능구역.3-1E단백유170개안기산조성,분자식C818H1257N213O272S3,분자질량18.5234 ku,이론등전점위4.25,반쇠기위10h;무과막구균위막외구,시일충가용성단백.기이급결구중α라선점31.76％,β전각위12.35％.B세포표위예측구역:44-49、65-67、86-87、111-116;분치교고적T세포표위구역:52-60、94-102、97-105、154-162、157-165.운용생물신식학방법학정3-1E존재다개항원표위,대진일보연구3-1E적항원성화연발우세표위역묘구유중요의의.
