生物技术通讯
生物技術通訊
생물기술통신
LETTERS IN BIOTECHNOLOGY
2015年
3期
408-410
,共3页
徐晓蒙%康怀兴%张志毅%童贻刚
徐曉矇%康懷興%張誌毅%童貽剛
서효몽%강부흥%장지의%동이강
高通量测序%重复序列%基因组序列组装%实时定量PCR
高通量測序%重複序列%基因組序列組裝%實時定量PCR
고통량측서%중복서렬%기인조서렬조장%실시정량PCR
high-throughput sequencing%repetitive DNA%genome sequence assembly%real-time PCR
目的:探寻一种简单、经济的方法,解决基因组序列拼接中的重复序列问题.方法:选取序列拼接中遇到重复序列问题的质粒NDM-BTR,在其与重复序列相关的contigs两端设计引物,进行实时定量PCR,通过观察临界循环数来判断contig之间的位置关系.结果:成功判断出质粒contig之间的位置关系,得到了质粒基因组完成图.结论:实时定量PCR法可用于解决基因组序列拼接中的重复序列问题,相比较传统建立大片段文库更加简单、快速、经济.
目的:探尋一種簡單、經濟的方法,解決基因組序列拼接中的重複序列問題.方法:選取序列拼接中遇到重複序列問題的質粒NDM-BTR,在其與重複序列相關的contigs兩耑設計引物,進行實時定量PCR,通過觀察臨界循環數來判斷contig之間的位置關繫.結果:成功判斷齣質粒contig之間的位置關繫,得到瞭質粒基因組完成圖.結論:實時定量PCR法可用于解決基因組序列拼接中的重複序列問題,相比較傳統建立大片段文庫更加簡單、快速、經濟.
목적:탐심일충간단、경제적방법,해결기인조서렬병접중적중복서렬문제.방법:선취서렬병접중우도중복서렬문제적질립NDM-BTR,재기여중복서렬상관적contigs량단설계인물,진행실시정량PCR,통과관찰림계순배수래판단contig지간적위치관계.결과:성공판단출질립contig지간적위치관계,득도료질립기인조완성도.결론:실시정량PCR법가용우해결기인조서렬병접중적중복서렬문제,상비교전통건립대편단문고경가간단、쾌속、경제.
