国际医学寄生虫病杂志
國際醫學寄生蟲病雜誌
국제의학기생충병잡지
INTERNATIONAL JOURNAL OF MEDICAL PARASITIC DISEASES
2015年
4期
221-226
,共6页
细粒棘球蚴%14-3-3抗原%抗原表位%生物信息学
細粒棘毬蚴%14-3-3抗原%抗原錶位%生物信息學
세립극구유%14-3-3항원%항원표위%생물신식학
Echinoccocus granulosus%14-3-3 antigen%Antigenic epitope%Bioinformatics
目的 应用生物信息软件分析细粒棘球蚴14-3-3 (Eg14-3-3)蛋白氨基酸序列、二级结构、三级结构并预测B细胞表位和T细胞表位,为后续确定和筛选优势抗原表位、研制安全高效的多肽疫苗及特异性诊断抗原奠定基础. 方法 采用DNAstar软件、ProPred MHC Class-Ⅱ Binding Peptide Prediction Server和Biosun等软件对Eg14-3-3的序列、结构及B细胞表位和T细胞表位进行预测. 结果 Eg14-3-3为相对分子质量27 940、含有247个氨基酸的酸性蛋白质,其二级结构主要由有6个α-helix结构中间连接短β-折叠及不规则卷曲结构,序列具有高度多变性,预测该蛋白存在14个B细胞表位区域和6个T细胞表位. 结论 分析了蛋白氨基酸序列、二级结构、三级结构,并预测出Eg14-3-3存在14个B细胞表位和6个T细胞表位.
目的 應用生物信息軟件分析細粒棘毬蚴14-3-3 (Eg14-3-3)蛋白氨基痠序列、二級結構、三級結構併預測B細胞錶位和T細胞錶位,為後續確定和篩選優勢抗原錶位、研製安全高效的多肽疫苗及特異性診斷抗原奠定基礎. 方法 採用DNAstar軟件、ProPred MHC Class-Ⅱ Binding Peptide Prediction Server和Biosun等軟件對Eg14-3-3的序列、結構及B細胞錶位和T細胞錶位進行預測. 結果 Eg14-3-3為相對分子質量27 940、含有247箇氨基痠的痠性蛋白質,其二級結構主要由有6箇α-helix結構中間連接短β-摺疊及不規則捲麯結構,序列具有高度多變性,預測該蛋白存在14箇B細胞錶位區域和6箇T細胞錶位. 結論 分析瞭蛋白氨基痠序列、二級結構、三級結構,併預測齣Eg14-3-3存在14箇B細胞錶位和6箇T細胞錶位.
목적 응용생물신식연건분석세립극구유14-3-3 (Eg14-3-3)단백안기산서렬、이급결구、삼급결구병예측B세포표위화T세포표위,위후속학정화사선우세항원표위、연제안전고효적다태역묘급특이성진단항원전정기출. 방법 채용DNAstar연건、ProPred MHC Class-Ⅱ Binding Peptide Prediction Server화Biosun등연건대Eg14-3-3적서렬、결구급B세포표위화T세포표위진행예측. 결과 Eg14-3-3위상대분자질량27 940、함유247개안기산적산성단백질,기이급결구주요유유6개α-helix결구중간련접단β-절첩급불규칙권곡결구,서렬구유고도다변성,예측해단백존재14개B세포표위구역화6개T세포표위. 결론 분석료단백안기산서렬、이급결구、삼급결구,병예측출Eg14-3-3존재14개B세포표위화6개T세포표위.
Objective To analyze and predict the animo acid sequence,secondary and tertiary structure,and B cell and T cell epitopes of Echinoccocus granulosus protein 14-3-3 with bioinformatics tools for screening epitopes vaccine and diagnostic antigen.Methods The protein secondary structure was analyzed by DNAstar,and B cell and T cell epitopes of Eg14-3-3 were predicted by DNAstar,Biosun software and Propred MHC class-Ⅱ Binding Peptide Prediction Server software,the tertiary structure was predicted with Swiss-model and Rasmol software.Results Eg14-3-3 is a kind of acid protein consisting of 247 amino acids,with Mr 27 940.The secondary structure containing 6 α-helix linked with short β-sheet and coil,the sequence has high variability.14 B cell epitopes and 6 T cell epitopes were predicted.Conclution The study analyzed the sequence,secondary structure and tertiary structure of Eg14-3-3 and 14 B cell epitopes and 6 T cell epitopes predicted.