智能计算机与应用
智能計算機與應用
지능계산궤여응용
Computer Study
2015年
3期
23-25
,共3页
生物信息学%新一代测序技术%基因组序列拼接
生物信息學%新一代測序技術%基因組序列拼接
생물신식학%신일대측서기술%기인조서렬병접
针对新一代测序技术数据读取片段reads长度短、准确度低、数据海量等特点,本文提出了基于reads引导的基因组序列拼接算法(SRGA),以整条reads为拼接单位,并首次提出了基于数据特征和拼接信息累计的评分机制.选取常用测试集,将本文中的算法与序列拼接领域中的经典算法进行对比和分析,取得了较好的效果.
針對新一代測序技術數據讀取片段reads長度短、準確度低、數據海量等特點,本文提齣瞭基于reads引導的基因組序列拼接算法(SRGA),以整條reads為拼接單位,併首次提齣瞭基于數據特徵和拼接信息纍計的評分機製.選取常用測試集,將本文中的算法與序列拼接領域中的經典算法進行對比和分析,取得瞭較好的效果.
침대신일대측서기술수거독취편단reads장도단、준학도저、수거해량등특점,본문제출료기우reads인도적기인조서렬병접산법(SRGA),이정조reads위병접단위,병수차제출료기우수거특정화병접신식루계적평분궤제.선취상용측시집,장본문중적산법여서렬병접영역중적경전산법진행대비화분석,취득료교호적효과.
