遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2015年
7期
692-701
,共10页
马建江%王诺菡%吴嫚%裴文锋%王文魁%李兴丽%张金发%喻树迅%于霁雯
馬建江%王諾菡%吳嫚%裴文鋒%王文魁%李興麗%張金髮%喻樹迅%于霽雯
마건강%왕낙함%오만%배문봉%왕문괴%리흥려%장금발%유수신%우제문
油脂%LPAAT家族%基因结构%系统进化分析%表达分析
油脂%LPAAT傢族%基因結構%繫統進化分析%錶達分析
유지%LPAAT가족%기인결구%계통진화분석%표체분석
cottonseed oil%LPAAT family%gene structure%phylogenic analysis%expression analysis
溶血磷脂酸酰基转移酶(Lysophosphatidic acid acyltransferase,LPAAT)是油脂合成途径中的一个关键酶,能催化溶血磷脂酸转变为磷脂酸.本研究从雷蒙德氏棉(G.raimondii,D5)和亚洲棉(G.arboreum,A2)的基因组数据中得到17个LPAAT基因家族成员.利用生物信息学方法对二倍体棉花LPAAT基因进行基因结构、染色体分布以及系统进化分析.结果表明,LPAAT基因家族根据亲缘关系的远近可以分为不同的亚家族,各亚家族中LPAAT基因具有相似的基因结构;LPAAT家族基因编码的氨基酸序列具有3个保守基序,其中包括ΦFPEGTR-G结合位点和Φ-NHQS-ΦDΦΦ催化位点;通过对不同物种的LPAAT基因家族进行系统进化分析可知,不同物种中的LPAAT在进化中存在较大差异.基于陆地棉(G.hirsutum)不同发育时期的胚珠RNA-seq数据库和qRT-PCR表达分析,发现LPAAT基因可能对脂肪积累起到积极作用.本研究结果有助于了解棉属植物LPAAT基因家族的功能,以期从中选取较好的LPAAT基因进行进一步功能验证.
溶血燐脂痠酰基轉移酶(Lysophosphatidic acid acyltransferase,LPAAT)是油脂閤成途徑中的一箇關鍵酶,能催化溶血燐脂痠轉變為燐脂痠.本研究從雷矇德氏棉(G.raimondii,D5)和亞洲棉(G.arboreum,A2)的基因組數據中得到17箇LPAAT基因傢族成員.利用生物信息學方法對二倍體棉花LPAAT基因進行基因結構、染色體分佈以及繫統進化分析.結果錶明,LPAAT基因傢族根據親緣關繫的遠近可以分為不同的亞傢族,各亞傢族中LPAAT基因具有相似的基因結構;LPAAT傢族基因編碼的氨基痠序列具有3箇保守基序,其中包括ΦFPEGTR-G結閤位點和Φ-NHQS-ΦDΦΦ催化位點;通過對不同物種的LPAAT基因傢族進行繫統進化分析可知,不同物種中的LPAAT在進化中存在較大差異.基于陸地棉(G.hirsutum)不同髮育時期的胚珠RNA-seq數據庫和qRT-PCR錶達分析,髮現LPAAT基因可能對脂肪積纍起到積極作用.本研究結果有助于瞭解棉屬植物LPAAT基因傢族的功能,以期從中選取較好的LPAAT基因進行進一步功能驗證.
용혈린지산선기전이매(Lysophosphatidic acid acyltransferase,LPAAT)시유지합성도경중적일개관건매,능최화용혈린지산전변위린지산.본연구종뢰몽덕씨면(G.raimondii,D5)화아주면(G.arboreum,A2)적기인조수거중득도17개LPAAT기인가족성원.이용생물신식학방법대이배체면화LPAAT기인진행기인결구、염색체분포이급계통진화분석.결과표명,LPAAT기인가족근거친연관계적원근가이분위불동적아가족,각아가족중LPAAT기인구유상사적기인결구;LPAAT가족기인편마적안기산서렬구유3개보수기서,기중포괄ΦFPEGTR-G결합위점화Φ-NHQS-ΦDΦΦ최화위점;통과대불동물충적LPAAT기인가족진행계통진화분석가지,불동물충중적LPAAT재진화중존재교대차이.기우륙지면(G.hirsutum)불동발육시기적배주RNA-seq수거고화qRT-PCR표체분석,발현LPAAT기인가능대지방적루기도적겁작용.본연구결과유조우료해면속식물LPAAT기인가족적공능,이기종중선취교호적LPAAT기인진행진일보공능험증.
