黑龙江工程学院学报
黑龍江工程學院學報
흑룡강공정학원학보
JOURNAL OF HEILONGJIANG INSTITUTE OF TECHNOLOGY
2015年
4期
47-52
,共6页
佟良%周影%赵卫绩%丁慧%邹大伟%李成凤%马春华
佟良%週影%趙衛績%丁慧%鄒大偉%李成鳳%馬春華
동량%주영%조위적%정혜%추대위%리성봉%마춘화
QTL定位%F2群体%基因型误差%EM算法
QTL定位%F2群體%基因型誤差%EM算法
QTL정위%F2군체%기인형오차%EM산법
QTL mapping%F2 populations%genotyping errors%EM algorithm
由于人为和机械等原因,标记的基因型信息经常存在一部分错误。如果把这些信息直接当成真实的基因数据,势必给QTL的定位研究带来影响。文中考虑基于带有误差生物数据的QTL区间定位问题,通过分析各位点所有可能的基因型,借助EM算法推导全部模型参数的极大似然估计,并探讨Q T L存在与否的检验问题。针对F2代群体进行广泛的模拟研究,实际结果表明,该方法能够减少基因型误差给QTL定位带来的影响。
由于人為和機械等原因,標記的基因型信息經常存在一部分錯誤。如果把這些信息直接噹成真實的基因數據,勢必給QTL的定位研究帶來影響。文中攷慮基于帶有誤差生物數據的QTL區間定位問題,通過分析各位點所有可能的基因型,藉助EM算法推導全部模型參數的極大似然估計,併探討Q T L存在與否的檢驗問題。針對F2代群體進行廣汎的模擬研究,實際結果錶明,該方法能夠減少基因型誤差給QTL定位帶來的影響。
유우인위화궤계등원인,표기적기인형신식경상존재일부분착오。여과파저사신식직접당성진실적기인수거,세필급QTL적정위연구대래영향。문중고필기우대유오차생물수거적QTL구간정위문제,통과분석각위점소유가능적기인형,차조EM산법추도전부모형삼수적겁대사연고계,병탐토Q T L존재여부적검험문제。침대F2대군체진행엄범적모의연구,실제결과표명,해방법능구감소기인형오차급QTL정위대래적영향。
Due to man‐made and mechanical causes ,genotype information of markers always produce some errors .If the information is directly taken as real genetic data ,it will certainly influence the QTL mapping .As to the problem of QTL mapping based on biological data with genotyping errors ,analysis is made of all possible genotypes of each locus ,and with the aid of the EM algorithm ,the MLE of all model parameters is derived .Then the test of QTL existence is discussed .Simulation results show the proposed method in this paper can reduce the effects of genotype error on QTL mapping .