基础医学与临床
基礎醫學與臨床
기출의학여림상
BASIC MEDICAL SCIENCES AND CLINICS
2015年
8期
1078-1082
,共5页
姜华%高建鹏%王辉%张志波%王丽昆
薑華%高建鵬%王輝%張誌波%王麗昆
강화%고건붕%왕휘%장지파%왕려곤
全基因组表达芯片%间充质干细胞%肝样细胞%GO分析%Pathway分析
全基因組錶達芯片%間充質榦細胞%肝樣細胞%GO分析%Pathway分析
전기인조표체심편%간충질간세포%간양세포%GO분석%Pathway분석
whole genome expression chip%mesenchymal stem cells%hepatocyte-like cells%GO analysis%Pathway analysis
目的 用全基因表达谱芯片筛选大鼠骨髓间充质干细胞(MSCs)与定向分化为肝细胞样细胞(HLCs)的表达基因差异并对其进行分析研究.方法 将大鼠MSCs诱导定向分化的肝样细胞做3次生物学重复,分别取MSCs和诱导分化的肝样细胞提取总RNA进行扩增,Cy3标记.与大鼠全基因表达谱芯片杂交,荧光扫描,筛选出差异表达基因,并进行GO分析和pathway分析.用实时定量PCR对结果进行验证.结果 芯片筛选结果显示,分化后的MSCs与HLCs间的差异表达的基因多达839个,其中上调表达448个,下调表达391个.在差异基因当中有生物学过程注释的基因有363个,具有细胞组分注释的差异基因有377个,具有分子功能注释的差异基因364个.Pathway分析结果中显示在差异基因参与的273个Pathway中有显著性变化的Pathway有45个,其中参与到显著性Pathway共有275个差异表达基因,其中上调基因122个,下调基因153个.通过差异基因构建基因调控网络,按照基因在网络的度(Degree)筛选出网络当中的5个关键基因:Pkm2、Nt5e、Fos、Adcy3、Itga7.结论 MSCs体外诱导定向分化为HLCs过程中,其调节的基因与肝细胞中细胞增殖、分化、凋亡、代谢和调控等密切相关.
目的 用全基因錶達譜芯片篩選大鼠骨髓間充質榦細胞(MSCs)與定嚮分化為肝細胞樣細胞(HLCs)的錶達基因差異併對其進行分析研究.方法 將大鼠MSCs誘導定嚮分化的肝樣細胞做3次生物學重複,分彆取MSCs和誘導分化的肝樣細胞提取總RNA進行擴增,Cy3標記.與大鼠全基因錶達譜芯片雜交,熒光掃描,篩選齣差異錶達基因,併進行GO分析和pathway分析.用實時定量PCR對結果進行驗證.結果 芯片篩選結果顯示,分化後的MSCs與HLCs間的差異錶達的基因多達839箇,其中上調錶達448箇,下調錶達391箇.在差異基因噹中有生物學過程註釋的基因有363箇,具有細胞組分註釋的差異基因有377箇,具有分子功能註釋的差異基因364箇.Pathway分析結果中顯示在差異基因參與的273箇Pathway中有顯著性變化的Pathway有45箇,其中參與到顯著性Pathway共有275箇差異錶達基因,其中上調基因122箇,下調基因153箇.通過差異基因構建基因調控網絡,按照基因在網絡的度(Degree)篩選齣網絡噹中的5箇關鍵基因:Pkm2、Nt5e、Fos、Adcy3、Itga7.結論 MSCs體外誘導定嚮分化為HLCs過程中,其調節的基因與肝細胞中細胞增殖、分化、凋亡、代謝和調控等密切相關.
목적 용전기인표체보심편사선대서골수간충질간세포(MSCs)여정향분화위간세포양세포(HLCs)적표체기인차이병대기진행분석연구.방법 장대서MSCs유도정향분화적간양세포주3차생물학중복,분별취MSCs화유도분화적간양세포제취총RNA진행확증,Cy3표기.여대서전기인표체보심편잡교,형광소묘,사선출차이표체기인,병진행GO분석화pathway분석.용실시정량PCR대결과진행험증.결과 심편사선결과현시,분화후적MSCs여HLCs간적차이표체적기인다체839개,기중상조표체448개,하조표체391개.재차이기인당중유생물학과정주석적기인유363개,구유세포조분주석적차이기인유377개,구유분자공능주석적차이기인364개.Pathway분석결과중현시재차이기인삼여적273개Pathway중유현저성변화적Pathway유45개,기중삼여도현저성Pathway공유275개차이표체기인,기중상조기인122개,하조기인153개.통과차이기인구건기인조공망락,안조기인재망락적도(Degree)사선출망락당중적5개관건기인:Pkm2、Nt5e、Fos、Adcy3、Itga7.결론 MSCs체외유도정향분화위HLCs과정중,기조절적기인여간세포중세포증식、분화、조망、대사화조공등밀절상관.
