CAJ | 학술논문

从NCBI数据库中下载到50776条茶树表达序列标签(expressed sequence tags,EST)序列,利用Tandem Repeats Finder程序,对童24 bp的微卫星(简单重复序列)进行系统分析.结果表明,在所分析的茶树EST序列中,搜索到长度大于或等于24 bp,基序匹配值大于80％的微卫星序列5299个,在这些徽卫星中,单核甘酸的最多,数量达3283个,占SSR总教的61.96％,其次为2核甘酸微卫星序列,共1113个,占微卫星总数的21％.4核苷酸微卫星数量最少,仅39个,占总数的0.74％,搜索到6核苷酸471个,其基序组成可分为83类,优势基序为AAAACT(130个).以上结果说明茶树EST序列中含有丰富的微卫星,这非常有利于开发表达序列中的微卫星标记,为含有微卫星的基因的标识、表达提供了很好的基础.
종NCBI수거고중하재도50776조다수표체서렬표첨(expressed sequence tags,EST)서렬,이용Tandem Repeats Finder정서,대동24 bp적미위성(간단중복서렬)진행계통분석.결과표명,재소분석적다수EST서렬중,수색도장도대우혹등우24 bp,기서필배치대우80％적미위성서렬5299개,재저사휘위성중,단핵감산적최다,수량체3283개,점SSR총교적61.96％,기차위2핵감산미위성서렬,공1113개,점미위성총수적21％.4핵감산미위성수량최소,부39개,점총수적0.74％,수색도6핵감산471개,기기서조성가분위83류,우세기서위AAAACT(130개).이상결과설명다수EST서렬중함유봉부적미위성,저비상유리우개발표체서렬중적미위성표기,위함유미위성적기인적표식、표체제공료흔호적기출.