湖北农业科学
湖北農業科學
호북농업과학
Hubei Agricultural Sciences
2015年
13期
3273-3279
,共7页
蔡垚%李朝晖%虞蔚岩%任源浩
蔡垚%李朝暉%虞蔚巖%任源浩
채요%리조휘%우위암%임원호
二甲烯丙基色氨酸合成酶(DMATS)%系统发育%motif%生物信息学
二甲烯丙基色氨痠閤成酶(DMATS)%繫統髮育%motif%生物信息學
이갑희병기색안산합성매(DMATS)%계통발육%motif%생물신식학
dimethylallyl tryptophan synthetase (DMATS)%phylogenetic%motif%bioinformatics
以二甲烯丙基色氨酸合成酶(DMATS)为研究对象,通过生物信息学方法共检索到37种微生物中的77条DMATS蛋白质序列.使用MEGA v4.0软件构建DMATS系统进化树发现,这些同源序列可分为两大簇,在第一簇中全为真菌的聚类,而第二簇中是细菌和真菌的聚类,初步分析可能是由于细菌和真菌的进化速度不同或DMATS基因是一个独立复制事件.在进行DMATS的信号肽结构预测时发现,只有Ajellomyces capsulata的DMATS(登录号:C6HC16)含有信号肽结构,由此可知,Ajellomyces capsulata (C6HC16)的DMATS可能是分泌蛋白质.通过使用MEME v4.9进行分析,最终得到了7条保守的motifs序列,这些motifs可能对DMATS发挥功能具有重要作用.
以二甲烯丙基色氨痠閤成酶(DMATS)為研究對象,通過生物信息學方法共檢索到37種微生物中的77條DMATS蛋白質序列.使用MEGA v4.0軟件構建DMATS繫統進化樹髮現,這些同源序列可分為兩大簇,在第一簇中全為真菌的聚類,而第二簇中是細菌和真菌的聚類,初步分析可能是由于細菌和真菌的進化速度不同或DMATS基因是一箇獨立複製事件.在進行DMATS的信號肽結構預測時髮現,隻有Ajellomyces capsulata的DMATS(登錄號:C6HC16)含有信號肽結構,由此可知,Ajellomyces capsulata (C6HC16)的DMATS可能是分泌蛋白質.通過使用MEME v4.9進行分析,最終得到瞭7條保守的motifs序列,這些motifs可能對DMATS髮揮功能具有重要作用.
이이갑희병기색안산합성매(DMATS)위연구대상,통과생물신식학방법공검색도37충미생물중적77조DMATS단백질서렬.사용MEGA v4.0연건구건DMATS계통진화수발현,저사동원서렬가분위량대족,재제일족중전위진균적취류,이제이족중시세균화진균적취류,초보분석가능시유우세균화진균적진화속도불동혹DMATS기인시일개독립복제사건.재진행DMATS적신호태결구예측시발현,지유Ajellomyces capsulata적DMATS(등록호:C6HC16)함유신호태결구,유차가지,Ajellomyces capsulata (C6HC16)적DMATS가능시분비단백질.통과사용MEME v4.9진행분석,최종득도료7조보수적motifs서렬,저사motifs가능대DMATS발휘공능구유중요작용.
