上海交通大学学报（农业科学版）
上海交通大學學報（農業科學版）
상해교통대학학보（농업과학판）
Journal of Shanghai Jiaotong University(Agricultural Science)
2015年
4期
65-70,76
,共7页
杜杰%李红旺%高会晓%崔妍%杨润清
杜傑%李紅旺%高會曉%崔妍%楊潤清
두걸%리홍왕%고회효%최연%양윤청
LASSO%约束极大似然法%线性混合模型%系谱群体%基因定位
LASSO%約束極大似然法%線性混閤模型%繫譜群體%基因定位
LASSO%약속겁대사연법%선성혼합모형%계보군체%기인정위
LASSO%restricted maximum likelihood%linear mixed model%pedigree population%gene mapping
研究提出了一个同时含有主效基因和微效多基因的混合模型连锁分析方法.首先应用LASSO方法快速估计线性混合模型(LMM)非零的主效位点,并将这些位点效应视为固定效应;而后把基于约束极大似然法(REML)估计得到的微效多基因效应再放入LMM中作为随机效应;从而最终实现QTL遗传参数估计和基因定位连锁分析.针对系谱群体的定位分析,该模型,即LASSO-LMM法,不仅很好地继承了单独LASSO法的计算速度,而且还具有比单独LMM法更好的遗传参数估计稳健性.为了具体比较这3种定位方法,采用计算机模拟数据验证.结果表明,相比于单独LASSO法和单独LMM法,LASSO-LMM法在QTL遗传参数估计和统计效力上总体表现出更高的估计精确度和检测效率.
研究提齣瞭一箇同時含有主效基因和微效多基因的混閤模型連鎖分析方法.首先應用LASSO方法快速估計線性混閤模型(LMM)非零的主效位點,併將這些位點效應視為固定效應;而後把基于約束極大似然法(REML)估計得到的微效多基因效應再放入LMM中作為隨機效應;從而最終實現QTL遺傳參數估計和基因定位連鎖分析.針對繫譜群體的定位分析,該模型,即LASSO-LMM法,不僅很好地繼承瞭單獨LASSO法的計算速度,而且還具有比單獨LMM法更好的遺傳參數估計穩健性.為瞭具體比較這3種定位方法,採用計算機模擬數據驗證.結果錶明,相比于單獨LASSO法和單獨LMM法,LASSO-LMM法在QTL遺傳參數估計和統計效力上總體錶現齣更高的估計精確度和檢測效率.
연구제출료일개동시함유주효기인화미효다기인적혼합모형련쇄분석방법.수선응용LASSO방법쾌속고계선성혼합모형(LMM)비령적주효위점,병장저사위점효응시위고정효응;이후파기우약속겁대사연법(REML)고계득도적미효다기인효응재방입LMM중작위수궤효응;종이최종실현QTL유전삼수고계화기인정위련쇄분석.침대계보군체적정위분석,해모형,즉LASSO-LMM법,불부흔호지계승료단독LASSO법적계산속도,이차환구유비단독LMM법경호적유전삼수고계은건성.위료구체비교저3충정위방법,채용계산궤모의수거험증.결과표명,상비우단독LASSO법화단독LMM법,LASSO-LMM법재QTL유전삼수고계화통계효력상총체표현출경고적고계정학도화검측효솔.
