计算机科学
計算機科學
계산궤과학
Computer Science
2015年
8期
75-77,111
,共4页
G蛋白质偶联受体%药物%特征抽取%预测
G蛋白質偶聯受體%藥物%特徵抽取%預測
G단백질우련수체%약물%특정추취%예측
G-protein-coupled receptor%Drug%Feature extraction%Prediction
准确预测G蛋白质偶联受体(GPCR)是否与药物(Drug)相互作用是新药开发的关键步骤之一.从时间和费用方面来说,通过生物实验的方法来确定GPCR-Drug是否相互作用的代价是昂贵的.因此,直接从蛋白质序列出发预测GPCR-Drug的相互作用具有重要的意义.提出了一种基于序列的GPCR-Drug相互作用预测方法:从蛋白质序列抽取进化信息特征;对药物抽取指纹特征;基于上述两种特征,使用基于证据理论的K近邻算法进行分类预测.在标准数据集上的实验结果表明了所述方法的有效性.
準確預測G蛋白質偶聯受體(GPCR)是否與藥物(Drug)相互作用是新藥開髮的關鍵步驟之一.從時間和費用方麵來說,通過生物實驗的方法來確定GPCR-Drug是否相互作用的代價是昂貴的.因此,直接從蛋白質序列齣髮預測GPCR-Drug的相互作用具有重要的意義.提齣瞭一種基于序列的GPCR-Drug相互作用預測方法:從蛋白質序列抽取進化信息特徵;對藥物抽取指紋特徵;基于上述兩種特徵,使用基于證據理論的K近鄰算法進行分類預測.在標準數據集上的實驗結果錶明瞭所述方法的有效性.
준학예측G단백질우련수체(GPCR)시부여약물(Drug)상호작용시신약개발적관건보취지일.종시간화비용방면래설,통과생물실험적방법래학정GPCR-Drug시부상호작용적대개시앙귀적.인차,직접종단백질서렬출발예측GPCR-Drug적상호작용구유중요적의의.제출료일충기우서렬적GPCR-Drug상호작용예측방법:종단백질서렬추취진화신식특정;대약물추취지문특정;기우상술량충특정,사용기우증거이론적K근린산법진행분류예측.재표준수거집상적실험결과표명료소술방법적유효성.
