广东农业科学
廣東農業科學
엄동농업과학
Guangdong Agricultural Sciences
2015年
17期
139-146
,共8页
张玲%李彩霞%张海晨%马娜%杨娇%张晓东
張玲%李綵霞%張海晨%馬娜%楊嬌%張曉東
장령%리채하%장해신%마나%양교%장효동
滇龙胆%异戊烯基焦磷酸异构酶%基因克隆%生物信息学分析%表达分析
滇龍膽%異戊烯基焦燐痠異構酶%基因剋隆%生物信息學分析%錶達分析
전룡담%이무희기초린산이구매%기인극륭%생물신식학분석%표체분석
根据药用植物滇龙胆转录组异戊烯基焦磷酸异构酶基因(GrIDI)序列,应用RT-PCR技术从滇龙胆幼叶克隆该基因开放阅读框(ORF),获得GrIDI1和GrIDI2两条序列,其GenBank登录号分别为KM879183和KM879184.生物信息学分析表明GrIDI1基因ORF长708 bp,编码235氨基酸;GrIDI1蛋白相对分子质量为27.10 ku,理论pI为5.01.该蛋白属于Ⅰ型异戊烯基焦磷酸异构酶家族成员,可能定位于细胞质.该蛋白无信号肽,为亲水稳定蛋白,主要由α-螺旋(45.53％)和无规则卷曲(39.57％)构成.该蛋白具有其他IDI蛋白的活性位点、金属结合位点和保守结构域(NUDIX羟化酶结构域).GrIDI1蛋白与黄龙胆GlIDI蛋白亲缘关系最近.原核表达结果表明,GrIDI1基因在大肠杆菌中表达的重组蛋白相对分子质量约为53.11ku,与预期大小一致.组织特异性表达分析结果表明GrIDI1基因主要在叶中表达.
根據藥用植物滇龍膽轉錄組異戊烯基焦燐痠異構酶基因(GrIDI)序列,應用RT-PCR技術從滇龍膽幼葉剋隆該基因開放閱讀框(ORF),穫得GrIDI1和GrIDI2兩條序列,其GenBank登錄號分彆為KM879183和KM879184.生物信息學分析錶明GrIDI1基因ORF長708 bp,編碼235氨基痠;GrIDI1蛋白相對分子質量為27.10 ku,理論pI為5.01.該蛋白屬于Ⅰ型異戊烯基焦燐痠異構酶傢族成員,可能定位于細胞質.該蛋白無信號肽,為親水穩定蛋白,主要由α-螺鏇(45.53％)和無規則捲麯(39.57％)構成.該蛋白具有其他IDI蛋白的活性位點、金屬結閤位點和保守結構域(NUDIX羥化酶結構域).GrIDI1蛋白與黃龍膽GlIDI蛋白親緣關繫最近.原覈錶達結果錶明,GrIDI1基因在大腸桿菌中錶達的重組蛋白相對分子質量約為53.11ku,與預期大小一緻.組織特異性錶達分析結果錶明GrIDI1基因主要在葉中錶達.
근거약용식물전룡담전록조이무희기초린산이구매기인(GrIDI)서렬,응용RT-PCR기술종전룡담유협극륭해기인개방열독광(ORF),획득GrIDI1화GrIDI2량조서렬,기GenBank등록호분별위KM879183화KM879184.생물신식학분석표명GrIDI1기인ORF장708 bp,편마235안기산;GrIDI1단백상대분자질량위27.10 ku,이론pI위5.01.해단백속우Ⅰ형이무희기초린산이구매가족성원,가능정위우세포질.해단백무신호태,위친수은정단백,주요유α-라선(45.53％)화무규칙권곡(39.57％)구성.해단백구유기타IDI단백적활성위점、금속결합위점화보수결구역(NUDIX간화매결구역).GrIDI1단백여황룡담GlIDI단백친연관계최근.원핵표체결과표명,GrIDI1기인재대장간균중표체적중조단백상대분자질량약위53.11ku,여예기대소일치.조직특이성표체분석결과표명GrIDI1기인주요재협중표체.
