中国畜牧杂志
中國畜牧雜誌
중국축목잡지
Chinese Journal of Animal Science
2015年
17期
16-22
,共7页
郭发荣%陈彬%李太山%张小卿%綦世金
郭髮榮%陳彬%李太山%張小卿%綦世金
곽발영%진빈%리태산%장소경%기세금
IGF2基因%SNPs%系统发育%生物信息学%鸡
IGF2基因%SNPs%繫統髮育%生物信息學%鷄
IGF2기인%SNPs%계통발육%생물신식학%계
IGF2 gene%SNPs%phylogeny%bioinformatics%chicken
为全面了解IGF2基因的多态性、系统发育关系以及IGF2蛋白功能位点,本实验利用DNA池结合PCR产物直接测序法和生物信息学对9个鸡品种11种样本的IGF2基因进行系统研究.结果表明:共检测到IGF2基因的9个SNPs,其中3个错义突变导致蛋白性质发生改变;NJ树整体分为三大支,其中绿壳蛋鸡与其他品种遗传差异最大;突变后RNA二级结构、最小自由能和稳定性随之变化;IGF2蛋白存在典型跨膜螺旋区和信号肽,包含2个高度保守的结构功能域ⅡGF和IGF2-C;同源模建得到了理想可靠的IGF2蛋白三维结构模型.显示,IGF2基因遗传多样性相对较高,突变位点在各群体中分布不平衡,可为进一步研究IGF2蛋白功能奠定理论基础.
為全麵瞭解IGF2基因的多態性、繫統髮育關繫以及IGF2蛋白功能位點,本實驗利用DNA池結閤PCR產物直接測序法和生物信息學對9箇鷄品種11種樣本的IGF2基因進行繫統研究.結果錶明:共檢測到IGF2基因的9箇SNPs,其中3箇錯義突變導緻蛋白性質髮生改變;NJ樹整體分為三大支,其中綠殼蛋鷄與其他品種遺傳差異最大;突變後RNA二級結構、最小自由能和穩定性隨之變化;IGF2蛋白存在典型跨膜螺鏇區和信號肽,包含2箇高度保守的結構功能域ⅡGF和IGF2-C;同源模建得到瞭理想可靠的IGF2蛋白三維結構模型.顯示,IGF2基因遺傳多樣性相對較高,突變位點在各群體中分佈不平衡,可為進一步研究IGF2蛋白功能奠定理論基礎.
위전면료해IGF2기인적다태성、계통발육관계이급IGF2단백공능위점,본실험이용DNA지결합PCR산물직접측서법화생물신식학대9개계품충11충양본적IGF2기인진행계통연구.결과표명:공검측도IGF2기인적9개SNPs,기중3개착의돌변도치단백성질발생개변;NJ수정체분위삼대지,기중록각단계여기타품충유전차이최대;돌변후RNA이급결구、최소자유능화은정성수지변화;IGF2단백존재전형과막라선구화신호태,포함2개고도보수적결구공능역ⅡGF화IGF2-C;동원모건득도료이상가고적IGF2단백삼유결구모형.현시,IGF2기인유전다양성상대교고,돌변위점재각군체중분포불평형,가위진일보연구IGF2단백공능전정이론기출.
