CAJ | 학술논문

[目的]分离鉴定瓠瓜Lagenaria siceraria抗病种质的抗病基因同源序列(Resistance gene analogs,RGAs),为瓠瓜功能性抗病基因的克隆及分子标记辅助育种奠定基础.[方法]根据已知核苷酸结合位点和富亮氨酸重复(Nucleotide binding site and leucine rich repeat,NBS-LRR)类抗病基因保守区设计简并引物,从“大籽瓠”抗性材料基因组DNA中分离抗病基因同源序列,并利用生物信息学软件进行长度变异、保守结构域、同源比对与系统进化分析.[结果和结论]基于同源克隆策略,获得23条瓠瓜NBS抗病同源序列,命名为HNB1 ～ HNB23,GenBank登录号为KJ908192～KJ908214.序列分析及同源比对结果表明,这些RGAs长度变异在242 ～261 nt之间,18条序列具有连续开放阅读框(Open reading frame,ORF),推导氨基酸序列具有P-loop、Kinase-2a典型NBS类R基因保守结构域;核苷酸序列相似性为41.5％～ 98.8％,氨基酸序列相似性为21.5％～100.0％;利用NCBI Blast同源搜索发现,与其他植物尤其是冬瓜、黄瓜、葫芦及丝瓜的已知R基因具有40％～100％相似性;氨基酸序列聚类分析将其分为5个组;同源进化分析表明,23条瓠瓜RGAs均为non-TIR-NBS-LRR类R基因,与推导氨基酸序列多重比较结果一致.
[목적]분리감정호과Lagenaria siceraria항병충질적항병기인동원서렬(Resistance gene analogs,RGAs),위호과공능성항병기인적극륭급분자표기보조육충전정기출.[방법]근거이지핵감산결합위점화부량안산중복(Nucleotide binding site and leucine rich repeat,NBS-LRR)류항병기인보수구설계간병인물,종“대자호”항성재료기인조DNA중분리항병기인동원서렬,병이용생물신식학연건진행장도변이、보수결구역、동원비대여계통진화분석.[결과화결론]기우동원극륭책략,획득23조호과NBS항병동원서렬,명명위HNB1 ～ HNB23,GenBank등록호위KJ908192～KJ908214.서렬분석급동원비대결과표명,저사RGAs장도변이재242 ～261 nt지간,18조서렬구유련속개방열독광(Open reading frame,ORF),추도안기산서렬구유P-loop、Kinase-2a전형NBS류R기인보수결구역;핵감산서렬상사성위41.5％～ 98.8％,안기산서렬상사성위21.5％～100.0％;이용NCBI Blast동원수색발현,여기타식물우기시동과、황과、호호급사과적이지R기인구유40％～100％상사성;안기산서렬취류분석장기분위5개조;동원진화분석표명,23조호과RGAs균위non-TIR-NBS-LRR류R기인,여추도안기산서렬다중비교결과일치.