西北植物学报
西北植物學報
서북식물학보
Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica
2015年
7期
1385-1393
,共9页
高彩婷%刘景辉%徐寿军%张玉芹%于华荣
高綵婷%劉景輝%徐壽軍%張玉芹%于華榮
고채정%류경휘%서수군%장옥근%우화영
燕麦%盐胁迫%Illumina测序%表达谱%生理响应
燕麥%鹽脅迫%Illumina測序%錶達譜%生理響應
연맥%염협박%Illumina측서%표체보%생리향응
Oat%salt stress%Illumina sequencing%digital expression profiling%physiological response
以耐盐燕麦品种VAO-9为材料,通过Illumina测序与数字基因表达谱技术对300 mmol/L NaCl处理前后的叶片cDNA文库进行RNA-Seq与DGE分析,同时测定0(CK)、100、200、250、300 mmol/L NaCl胁迫下VAO-9幼苗叶片的相对电导率、丙二醛含量和脯氨酸含量,探讨燕麦盐胁迫响应基因的差异表达与生理响应的关系.结果表明:(1) RNA-Seq分析得到Unigenes 65 801条,其基因表达呈现高度的不均一性和冗余性;若差异基因表达谱鉴定分析以log2 Ratio≥2且FDR值≤0.001为选择标准,则发现上调和下调表达基因在胁迫0.5h时分别有306和64个,在胁迫3h时分别有639和290个,胁迫24 h时分别有1 488和882个.(2) KEGG代谢分析显示,有23 652条Unigenes比对到KEGG中的128条代谢途径,包括与逆境胁迫相关的植物激素信号转导途径、ABC转运蛋白途径、肌醇磷酸代谢途径、渗透调节途径等.(3)在300 mmol/L NaCl处理下燕麦叶片的相对电导率、丙二醛含量、脯氨酸含量等生理指标的变化与相关差异表达基因的变化趋势基本一致,说明基因差异表达量与生理反应密切相关.研究认为,在相同的栽培及胁迫处理条件下,可根据植物盐响应生理指标的变化判断耐盐基因的表达情况.
以耐鹽燕麥品種VAO-9為材料,通過Illumina測序與數字基因錶達譜技術對300 mmol/L NaCl處理前後的葉片cDNA文庫進行RNA-Seq與DGE分析,同時測定0(CK)、100、200、250、300 mmol/L NaCl脅迫下VAO-9幼苗葉片的相對電導率、丙二醛含量和脯氨痠含量,探討燕麥鹽脅迫響應基因的差異錶達與生理響應的關繫.結果錶明:(1) RNA-Seq分析得到Unigenes 65 801條,其基因錶達呈現高度的不均一性和冗餘性;若差異基因錶達譜鑒定分析以log2 Ratio≥2且FDR值≤0.001為選擇標準,則髮現上調和下調錶達基因在脅迫0.5h時分彆有306和64箇,在脅迫3h時分彆有639和290箇,脅迫24 h時分彆有1 488和882箇.(2) KEGG代謝分析顯示,有23 652條Unigenes比對到KEGG中的128條代謝途徑,包括與逆境脅迫相關的植物激素信號轉導途徑、ABC轉運蛋白途徑、肌醇燐痠代謝途徑、滲透調節途徑等.(3)在300 mmol/L NaCl處理下燕麥葉片的相對電導率、丙二醛含量、脯氨痠含量等生理指標的變化與相關差異錶達基因的變化趨勢基本一緻,說明基因差異錶達量與生理反應密切相關.研究認為,在相同的栽培及脅迫處理條件下,可根據植物鹽響應生理指標的變化判斷耐鹽基因的錶達情況.
이내염연맥품충VAO-9위재료,통과Illumina측서여수자기인표체보기술대300 mmol/L NaCl처리전후적협편cDNA문고진행RNA-Seq여DGE분석,동시측정0(CK)、100、200、250、300 mmol/L NaCl협박하VAO-9유묘협편적상대전도솔、병이철함량화포안산함량,탐토연맥염협박향응기인적차이표체여생리향응적관계.결과표명:(1) RNA-Seq분석득도Unigenes 65 801조,기기인표체정현고도적불균일성화용여성;약차이기인표체보감정분석이log2 Ratio≥2차FDR치≤0.001위선택표준,칙발현상조화하조표체기인재협박0.5h시분별유306화64개,재협박3h시분별유639화290개,협박24 h시분별유1 488화882개.(2) KEGG대사분석현시,유23 652조Unigenes비대도KEGG중적128조대사도경,포괄여역경협박상관적식물격소신호전도도경、ABC전운단백도경、기순린산대사도경、삼투조절도경등.(3)재300 mmol/L NaCl처리하연맥협편적상대전도솔、병이철함량、포안산함량등생리지표적변화여상관차이표체기인적변화추세기본일치,설명기인차이표체량여생리반응밀절상관.연구인위,재상동적재배급협박처리조건하,가근거식물염향응생리지표적변화판단내염기인적표체정황.