中山大学学报(自然科学版)
中山大學學報(自然科學版)
중산대학학보(자연과학판)
Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni
2015年
5期
109-114
,共6页
DNA双链断裂%MonteCarlo模拟%外源性DNA损伤%内源性DNA损伤%修复
DNA雙鏈斷裂%MonteCarlo模擬%外源性DNA損傷%內源性DNA損傷%脩複
DNA쌍련단렬%MonteCarlo모의%외원성DNA손상%내원성DNA손상%수복
DNA double strand breaks%Monte Carlo simulation%extrinsic DNA damage%intrinsic DNA damage%repair
DNA 双链断裂是一种非常严重的 DNA 损伤。对 DNA 双链断裂有效的修复对于维持基因组的稳定至关重要。对 DNA 双链断裂修复的动力学研究一直得到了广泛的关注。然而,以往的模型研究都没有充分考虑外源性和内源性 DNA 损伤修复之间的关联。因此,通过在细胞周期重启后引入自发生成的随机 DNA 双键断裂损伤,并设定触发细胞周期阻滞的阈值,一个精细化的 Monte Carlo 模型被构建并可以更好的模拟受迫状态下的损伤修复过程。细胞首先修复辐射刺激造成的 DNA 损伤,接着在总损伤水平低于特定阈值后产生内源性的 DNA 损伤并可能在某特定时间段内对两种来源损伤同时进行修复。本模型综合考虑了外源性和内源性 DNA 损伤修复的整合效应,为其它涵盖 DNA 损伤修复模块的模型研究提供了基础。
DNA 雙鏈斷裂是一種非常嚴重的 DNA 損傷。對 DNA 雙鏈斷裂有效的脩複對于維持基因組的穩定至關重要。對 DNA 雙鏈斷裂脩複的動力學研究一直得到瞭廣汎的關註。然而,以往的模型研究都沒有充分攷慮外源性和內源性 DNA 損傷脩複之間的關聯。因此,通過在細胞週期重啟後引入自髮生成的隨機 DNA 雙鍵斷裂損傷,併設定觸髮細胞週期阻滯的閾值,一箇精細化的 Monte Carlo 模型被構建併可以更好的模擬受迫狀態下的損傷脩複過程。細胞首先脩複輻射刺激造成的 DNA 損傷,接著在總損傷水平低于特定閾值後產生內源性的 DNA 損傷併可能在某特定時間段內對兩種來源損傷同時進行脩複。本模型綜閤攷慮瞭外源性和內源性 DNA 損傷脩複的整閤效應,為其它涵蓋 DNA 損傷脩複模塊的模型研究提供瞭基礎。
DNA 쌍련단렬시일충비상엄중적 DNA 손상。대 DNA 쌍련단렬유효적수복대우유지기인조적은정지관중요。대 DNA 쌍련단렬수복적동역학연구일직득도료엄범적관주。연이,이왕적모형연구도몰유충분고필외원성화내원성 DNA 손상수복지간적관련。인차,통과재세포주기중계후인입자발생성적수궤 DNA 쌍건단렬손상,병설정촉발세포주기조체적역치,일개정세화적 Monte Carlo 모형피구건병가이경호적모의수박상태하적손상수복과정。세포수선수복복사자격조성적 DNA 손상,접착재총손상수평저우특정역치후산생내원성적 DNA 손상병가능재모특정시간단내대량충래원손상동시진행수복。본모형종합고필료외원성화내원성 DNA 손상수복적정합효응,위기타함개 DNA 손상수복모괴적모형연구제공료기출。
DNA double strand breaks (DSBs)pose serious threat to life.Efficient repair of DSBs is cru-cial for maintaining genomic integrity.Dynamic investigations of DSB repair have received intensive at-tention.However,previous models do not take into account the relation between extrinsic and intrinsic DNA damage.Therefore,a refined Monte Carlo model was constructed by considering spontaneous DNA damage and setting a threshold for cell cycle reentry.The refined model can better describe the dynamic DSB repair under stressed conditions.Extrinsic DSBs induced by irradiation were first fixed.When the level of damage falls below the threshold,intrinsic DNA damage will then emerge and both the extrinsic and intrinsic DSBs will possibly be simultaneously repaired during a specific period.The current model integrates both extrinsic and intrinsic DNA damage and sets a fertile ground for other models with DNA damage repair process.