中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
Chinese Journal of Zoonoses
2015年
8期
700-703
,共4页
刘志国%崔步云%王妙%刘日宏%夏咸柱
劉誌國%崔步雲%王妙%劉日宏%夏鹹柱
류지국%최보운%왕묘%류일굉%하함주
布氏菌%16S rDNA%遗传进化%分析
佈氏菌%16S rDNA%遺傳進化%分析
포씨균%16S rDNA%유전진화%분석
Brucella%16S rDNA%genetic evolution%analysis
目的 检测内蒙古布氏菌临床分离株的16SrDNA基因序列,构建16SrDNA遗传进化树,确定该菌株的分类地位.方法 用BCSP31-PCR对临床分离株检测,再进行16SrDNA双向测序;从GeneBank下载标准参考菌株和与布氏菌有共同抗原细菌的16SrDNA基因序列;用Mega6.0进行序列比对并构建遗传进化树.结果 BCSP31-PCR结果显示均有223 bp扩增条带,16SrDNA测序得到单一基因序列;比对后发现有4处特异片段,经Blast比对,位于844-1224包括380 bp的片段为布氏菌独有;进化树显示布氏菌临床分离株与标准菌株聚在1个末端分支上,遗传距离接近0,无法精细区分相互关系;与人苍白杆菌聚集在1个亚分支上,遗传距离0.019;与其它试验菌株如霍乱弧菌、小肠结肠炎耶尔菌遗传进化距离较远,遗传距离＞0.02.结论 从遗传进化角度对布氏菌分离株与标准菌株的亲缘关系进行分析,布氏菌所有种型遗传距离接近,提示布氏菌16SrDNA为高度保守序列,不宜做遗传进化分析的靶基因;布氏菌与人苍白杆菌有较近的亲缘关系;布氏菌属16SrDNA特有的380 bp的基因片段可作为布氏菌快速鉴定的靶序列.
目的 檢測內矇古佈氏菌臨床分離株的16SrDNA基因序列,構建16SrDNA遺傳進化樹,確定該菌株的分類地位.方法 用BCSP31-PCR對臨床分離株檢測,再進行16SrDNA雙嚮測序;從GeneBank下載標準參攷菌株和與佈氏菌有共同抗原細菌的16SrDNA基因序列;用Mega6.0進行序列比對併構建遺傳進化樹.結果 BCSP31-PCR結果顯示均有223 bp擴增條帶,16SrDNA測序得到單一基因序列;比對後髮現有4處特異片段,經Blast比對,位于844-1224包括380 bp的片段為佈氏菌獨有;進化樹顯示佈氏菌臨床分離株與標準菌株聚在1箇末耑分支上,遺傳距離接近0,無法精細區分相互關繫;與人蒼白桿菌聚集在1箇亞分支上,遺傳距離0.019;與其它試驗菌株如霍亂弧菌、小腸結腸炎耶爾菌遺傳進化距離較遠,遺傳距離＞0.02.結論 從遺傳進化角度對佈氏菌分離株與標準菌株的親緣關繫進行分析,佈氏菌所有種型遺傳距離接近,提示佈氏菌16SrDNA為高度保守序列,不宜做遺傳進化分析的靶基因;佈氏菌與人蒼白桿菌有較近的親緣關繫;佈氏菌屬16SrDNA特有的380 bp的基因片段可作為佈氏菌快速鑒定的靶序列.
목적 검측내몽고포씨균림상분리주적16SrDNA기인서렬,구건16SrDNA유전진화수,학정해균주적분류지위.방법 용BCSP31-PCR대림상분리주검측,재진행16SrDNA쌍향측서;종GeneBank하재표준삼고균주화여포씨균유공동항원세균적16SrDNA기인서렬;용Mega6.0진행서렬비대병구건유전진화수.결과 BCSP31-PCR결과현시균유223 bp확증조대,16SrDNA측서득도단일기인서렬;비대후발현유4처특이편단,경Blast비대,위우844-1224포괄380 bp적편단위포씨균독유;진화수현시포씨균림상분리주여표준균주취재1개말단분지상,유전거리접근0,무법정세구분상호관계;여인창백간균취집재1개아분지상,유전거리0.019;여기타시험균주여곽란호균、소장결장염야이균유전진화거리교원,유전거리＞0.02.결론 종유전진화각도대포씨균분리주여표준균주적친연관계진행분석,포씨균소유충형유전거리접근,제시포씨균16SrDNA위고도보수서렬,불의주유전진화분석적파기인;포씨균여인창백간균유교근적친연관계;포씨균속16SrDNA특유적380 bp적기인편단가작위포씨균쾌속감정적파서렬.
