江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
Jiangsu Agricultural Sciences
2015年
9期
20-24,25
,共6页
张永利%孟晓烨%孙婷梅%李爱%彭立新
張永利%孟曉燁%孫婷梅%李愛%彭立新
장영리%맹효엽%손정매%리애%팽립신
珠美海棠%Mz2 NHX1 基因%克隆%生物信息学%耐盐机理
珠美海棠%Mz2 NHX1 基因%剋隆%生物信息學%耐鹽機理
주미해당%Mz2 NHX1 기인%극륭%생물신식학%내염궤리
以珠美海棠幼苗根系的 cDNA 为模板,根据珠美海棠 NHX1(GQ503257)的保守序列设计引物,通过RT -PCR 扩增得到目的基因全长1865 bp,包含1个1635 bp 的开放阅读框,编码544个氨基酸,其核苷酸序列与苹果(GU338395)、玫瑰(KC188664)、杨树(ACU01853)的核苷酸序列同源性分别是95%、93%、91%。其对应的氨基酸序列与拟南芥(AAF21755)、玫瑰(BAD93487.1)和大叶补血草(BAB11940)液泡型 Na +/H +逆向转运蛋白的氨基酸序列的同源性分别是79%、87%、79%,说明该蛋白是一种定位于液泡膜的 Na +/H +逆向转运蛋白,该基因属于液泡膜Na +/H +逆向转运蛋白基因。它编码的蛋白质分子量为60.5 ku,理论等电点(pI)为8.85,二级结构主要由α-螺旋、β-折叠和不规则卷曲构成,其 N -末端具有12个跨膜疏水片段,C -末端具有亲水的长链尾巴,在跨膜片段内含有氨基酸保守序列85-LFFIYLLPPI -94,是 Na +/H +逆向转运蛋白抑制剂氨氯吡嗪咪的结合位点。
以珠美海棠幼苗根繫的 cDNA 為模闆,根據珠美海棠 NHX1(GQ503257)的保守序列設計引物,通過RT -PCR 擴增得到目的基因全長1865 bp,包含1箇1635 bp 的開放閱讀框,編碼544箇氨基痠,其覈苷痠序列與蘋果(GU338395)、玫瑰(KC188664)、楊樹(ACU01853)的覈苷痠序列同源性分彆是95%、93%、91%。其對應的氨基痠序列與擬南芥(AAF21755)、玫瑰(BAD93487.1)和大葉補血草(BAB11940)液泡型 Na +/H +逆嚮轉運蛋白的氨基痠序列的同源性分彆是79%、87%、79%,說明該蛋白是一種定位于液泡膜的 Na +/H +逆嚮轉運蛋白,該基因屬于液泡膜Na +/H +逆嚮轉運蛋白基因。它編碼的蛋白質分子量為60.5 ku,理論等電點(pI)為8.85,二級結構主要由α-螺鏇、β-摺疊和不規則捲麯構成,其 N -末耑具有12箇跨膜疏水片段,C -末耑具有親水的長鏈尾巴,在跨膜片段內含有氨基痠保守序列85-LFFIYLLPPI -94,是 Na +/H +逆嚮轉運蛋白抑製劑氨氯吡嗪咪的結閤位點。
이주미해당유묘근계적 cDNA 위모판,근거주미해당 NHX1(GQ503257)적보수서렬설계인물,통과RT -PCR 확증득도목적기인전장1865 bp,포함1개1635 bp 적개방열독광,편마544개안기산,기핵감산서렬여평과(GU338395)、매괴(KC188664)、양수(ACU01853)적핵감산서렬동원성분별시95%、93%、91%。기대응적안기산서렬여의남개(AAF21755)、매괴(BAD93487.1)화대협보혈초(BAB11940)액포형 Na +/H +역향전운단백적안기산서렬적동원성분별시79%、87%、79%,설명해단백시일충정위우액포막적 Na +/H +역향전운단백,해기인속우액포막Na +/H +역향전운단백기인。타편마적단백질분자량위60.5 ku,이론등전점(pI)위8.85,이급결구주요유α-라선、β-절첩화불규칙권곡구성,기 N -말단구유12개과막소수편단,C -말단구유친수적장련미파,재과막편단내함유안기산보수서렬85-LFFIYLLPPI -94,시 Na +/H +역향전운단백억제제안록필진미적결합위점。